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J-GLOBAL ID：201302234037395612   整理番号：13A0894577

EBSeq RNA配列実験における推論に対する経験的Bayes階層モデル

EBSeq: an empirical Bayes hierarchical model for inference in RNA-seq experiments

著者 (10件)： LENG Ning (Univ. Wisconsin, WI) ,  DAWSON John A. (Univ. Wisconsin, WI) ,  THOMSON James A. (Morgridge Inst. Res., WI) ,  RUOTTI Victor (Morgridge Inst. Res., WI) ,  RISSMAN Anna I. (Univ. Wisconsin, WI) ,  SMITS Bart M. G. (Univ. Wisconsin, WI) ,  HAAG Jill D. (Univ. Wisconsin, WI) ,  GOULD Michael N. (Univ. Wisconsin, WI) ,  STEWART Ron M. (Morgridge Inst. Res., WI) ,  KENDZIORSKI Christina (Univ. Wisconsin, WI)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 8  ページ： 1035-1043  発行年： 2013年04月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA配列実験によりゲノムワイドスケールでの差次的発現(DE)遺伝子およびその対応するアイソフォームの同定を行うことができるが,正確な同定のためには統計的方法が必要とされる。アイソフォームDEを調べるとき,アイソフォーム計数の推定に対し遺伝子レベル法を用いることが多い。アイソフォーム発現の推定はあるグループのアイソフォームでは簡単であるが,他のものでは困難である。これは,推定を不確かなものにする。実験的Bayes法のメリットを利用して,2つ以上の生物学条件を比較するRNA配列実験におけるDEアイソフォーム同定のためのEBSeqを開発した。DEアイソフォーム同定のためのEBSeqの能力および性能の改善を結果が示した。

シソーラス用語： 遺伝学実験技術 ,  *RNA【核酸】 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *Bayes推定 ,  *モデル ,  解析 ,  ゲノム ,  遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  形態 ,  統計的方法 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *RNA配列解析 ,  アイソフォーム ,  *階層モデル ,  差次的発現

分類 (4件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  統計的品質管理  (KB04030W) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： RNA ,  実験 ,  推論 ,  経験 ,  階層モデル