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J-GLOBAL ID：201302236071903530   整理番号：13A1445740

RNA誘導性Cas9ヌクレアーゼのDNA標的特異性

DNA targeting specificity of RNA-guided Cas9 nucleases

著者 (26件)： HSU Patrick D (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  SCOTT David A (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  WEINSTEIN Joshua A (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  RAN F Ann (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  KONERMANN Silvana (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  AGARWALA Vineeta (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LI Yinqing (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  SHALEM Ophir (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  ZHANG Feng (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HSU Patrick D (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  SCOTT David A (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  WEINSTEIN Joshua A (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  RAN F Ann (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  KONERMANN Silvana (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  LI Yinqing (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  SHALEM Ophir (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  ZHANG Feng (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  HSU Patrick D (Harvard Univ., Massachusetts, USA) ,  RAN F Ann (Harvard Univ., Massachusetts, USA) ,  AGARWALA Vineeta (Harvard Univ., Massachusetts, USA) ,  AGARWALA Vineeta (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  FINE Eli J (Dep. of Biomedical Engineering, Georgia Inst. of Technol. and Emory Univ., Georgia, USA) ,  CRADICK Thomas J (Dep. of Biomedical Engineering, Georgia Inst. of Technol. and Emory Univ., Georgia, USA) ,  BAO Gang (Dep. of Biomedical Engineering, Georgia Inst. of Technol. and Emory Univ., Georgia, USA) ,  WU Xuebing (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  MARRAFFINI Luciano A (Rockefeller Univ., New York, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 31  号： 9  ページ： 827-832  発行年： 2013年09月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 化膿連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)のCas9(SpCas9)ヌクレアーゼは,シングルガイドRNA(sgRNA)によってゲノム遺伝子座を効率よく標的とすることができ,ゲノム編集を可能とする。今回,標的部位の選択に関する情報を得て標的外の作用を回避するために,SpCas9のヒト細胞での標的特異性を明らかにした。700個以上のガイドRNA変異体およびSpCas9が誘導する挿入欠失変異のレベルの評価を,293T細胞および293FT細胞のゲノム上の100か所以上の推定標的外遺伝子座を対象に行った。その結果,SpCas9はさまざまな位置でガイドRNAと標的DNAとのミスマッチを塩基配列依存的に許容するが,それはミスマッチの数,位置,および分布の影響を受けることがわかった。さらに,SpCas9による切断がDNAメチル化の影響を受けず,SpCas9およびsgRNAの量を調節することで標的外の改変が最小化されることも明らかにされた。哺乳類ゲノム操作への応用を促すために,我々は,標的配列の選択および検証,ならびに標的外の解析を支援するソフトウェアツールをウェブ上で提供する。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： 溶血性連鎖球菌 ,  *ヌクレアーゼ ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子ターゲティング ,  *変異誘発 ,  突然変異 ,  培養細胞 ,  ヒト ,  不適正塩基対 ,  支援プログラム
準シソーラス用語： 293FT細胞 ,  293T細胞 ,  INDEL突然変異

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (6件)： RNA ,  Cas9 ,  ヌクレアーゼ ,  DNA ,  標的 ,  特異性