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J-GLOBAL ID：201302237307058558   整理番号：13A1445291

侵入性ビルマニシキヘビ-Python molurus bivittatus-の情報を得るための次世代ピロシーケンシングを用いた高速マイクロサテライトマーカーの開発

Rapid Microsatellite Marker Development Using Next Generation Pyrosequencing to Inform Invasive Burmese Python-Python molurus bivittatus-Management

著者 (2件)： HUNTER Margaret E. (Southeast Ecological Sci. Center, FL, USA) ,  HART Kristen M. (Southeast Ecological Sci. Center, FL, USA)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 14  号： 3  ページ： 4793-4804 (WEB ONLY)  発行年： 2013年03月 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 侵入種は自然生態系に対する脅威の増加,捕食による生来分類群の損害,生息地改変,異種間交雑及び生態系プロセスの変化を表示する。その上,高い経済的コストは環境被害,回復及び防除手段と関係する。ビルマニシキヘビ,Python molurus bivittatusは広大なエバーグレイズ生態系及び絶滅危惧種にもたらす脅威から,アメリカで最も重要な侵入種の1つである。個体群構造と血縁関係に対処するために,次世代シークエンシングによって種特異的マイクロサテライト遺伝子座を高速に取り出した。ロッシュ454 GS-FLXチタニウムシリーズは117,5166配列中に616のジヌクレオチド,トリヌクレオチド及びテトラヌクレオチドに提示した。厳しい判定基準を用いて,26の選択したトリ及びテトラヌクレオチド遺伝子座のうち24をPCR法で増幅して18が多形であった。さらに6つの異種間遺伝子座を増幅し,得られた24の遺伝子座を8つのマルチプレックスPCRに導入した。マルチ遺伝子座の遺伝子型は,平均61%(39%.77%)のヘテロ接合性と遺伝子座当たり3.7(2.6)対立遺伝子を生成した。開発したマイクロサテライトに使用した個体群レベルの研究によって,侵入前線を追跡し,個体群-抑圧動特性を監視することができる。さらに,異種間増幅によって侵入Ball, P. regius及び 北アフリカニシキヘビ,P. sebaeを検出した。これらのマーカーを使用して,ビルマニシキヘビ及びより大型で,より攻撃的なP. sebaeの雑種形成能に取組むことが可能である。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *ヘビ科 ,  *遺伝学実験技術 ,  自動分析計 ,  生物 ,  遺伝子座 ,  マイクロサテライト ,  遺伝子多型 ,  遺伝子増幅 ,  遺伝学 ,  PCR法 ,  生態系 ,  外来種 ,  ミャンマー連邦共和国
準シソーラス用語： ミャンマー連邦 ,  *Python molurus bivittatus ,  *ピロシークエンシング ,  マイクロサテライト遺伝子座 ,  次世代シーケンサー ,  侵入種 ,  マイクロサテライト領域 ,  マルチプレックスPCR

分類 (2件)： 動物分類学  (EJ01030T) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 侵入 ,  ビルマ ,  Python ,  次世代 ,  ピロシーケンシング ,  マイクロサテライトマーカー ,  開発