細菌GH47α-マンノシダーゼの反応座標:量子力学的および構造的方法の組合せ

THOMPSON Andrew J.; DABIN Jerome; IGLESIAS-FERNANDEZ Javier; IGLESIAS-FERNANDEZ Javier; IGLESIAS-FERNANDEZ Javier; ARDEVOL Albert; ARDEVOL Albert; ARDEVOL Albert; DINEV Zoran; WILLIAMS Spencer J.; BANDE Omprakash; SIRIWARDENA Aloysius; MORELAND Carl; HU Ting-Chou; SMITH David K.; GILBERT Harry J.; ROVIRA Carme; ROVIRA Carme; ROVIRA Carme; ROVIRA Carme; DAVIES Gideon J.

文献

J-GLOBAL ID：201302245467123154 整理番号：12A1813364

細菌GH47α-マンノシダーゼの反応座標:量子力学的および構造的方法の組合せ

The Reaction Coordinate of a Bacterial GH47 α-Mannosidase: A Combined Quantum Mechanical and Structural Approach

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資料名：
巻： 51 号： 44 ページ： 10997-11001 発行年： 2012年
JST資料番号： H0127B ISSN： 1433-7851 CODEN： ACIEAY 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：ドイツ (DEU) 言語：英語 (EN)

多様なマンノシダーゼの反応座標は機構的に重要であり,マンノシドの化学情報を提供する。今回,Caulobacter種K31からの細菌GH47α-マンノシダーゼとのミカエリス複合体,遷移状態複合体と生成物類似複合体の構造分析について報告した。GH47結晶はÅ以下の分解能で検討した。S-架橋二糖基質ミメティックのミカエリス複合体はヒトオルソログと等しい歪曲を示したが,阻害剤マンノイミダゾールとネウロマイシンとの新規複合体は完全な立体配座座標を示した。即ち,マンノシドは,³S₁立体配座のミカエリス複合体から³H₄遷移状態を介して通過し,¹C₄立体配座の結合を示した。量子力学計算は,α-_D-マンノシダーゼ分子の自由エネルギー背景が障害を受け,単一立体配座系に制限されることを示した。本結果は,GH47ファミリーに関して単一反応座標の立体配座的進展を示唆した。

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分子構造 , 酵素一般

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