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J-GLOBAL ID：201302247082343237   整理番号：13A1533117

DockoMatic2.0: ハイスループット逆バーチャルスクリーニングとホモロジーモデリング

DockoMatic 2.0: High Throughput Inverse Virtual Screening and Homology Modeling

著者 (10件)： BULLOCK Casey (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  CORNIA Nic (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  JACOB Reed (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  REMM Andrew (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  PEAVEY Thomas (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  WEEKES Ken (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  MALLORY Chris (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  OXFORD Julia T. (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  MCDOUGAL Owen M. (Boise State Univ., Idaho, USA) ,  ANDERSEN Timothy L. (Boise State Univ., Idaho, USA)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 53  号： 8  ページ： 2161-2170  発行年： 2013年08月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DockoMaticはフリーのオープンソースアプリケーションであり,分子ドッキング実験を促進するユーザフレンドリーなプログラムの集合体である。ここでは,DockoMatic2.0のリリースについて述べる。DockoMatic2.0はハイスループット逆バーチャルスクリーニング(IVS)と3Dホモロジーモデル構築が可能で,ユーザインターフェースはカスタマイズ可能である。受容体とリガンドとグリッドパラメータとドッキングエンジンを特定することでIVS実験を管理できる。DockoMaticは必要な実験ファイルを自動的に作成し,ジョブ進行の確認も可能である。ジョブ完了時には,結果の要約が作成される。DockoMaticはタイムリー統合モデラーウイザードにより3D蛋白質ホモロジーモデルを構築するように拡張された。DockoMaticは全レベルの科学者に向けた包括的分子ドッキングソフトウェアである。

シソーラス用語： *GUI【計算機】 ,  *応用プログラム ,  *ユーザインタフェイス ,  人間工学 ,  ドッキング ,  分子認識 ,  *分子モデル ,  *ホモロジー ,  計算機シミュレーション ,  分子構造 ,  *スクリーニング ,  バーチャルリアリティ
準シソーラス用語： オープンソースソフトウェア ,  バーチャルスクリーニング ,  分子ドッキング

分類 (1件)： 薬物の研究法  (GV01020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： ハイスループット ,  バーチャルスクリーニング ,  ホモロジーモデリング