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J-GLOBAL ID：201302251361695493   整理番号：13A1566875

細菌Caldicellulosiruptor属におけるDNA形質転換に対する障壁としての制限の克服は効率的なマーカーの置換をもたらす

Overcoming restriction as a barrier to DNA transformation in Caldicellulosiruptor species results in efficient marker replacement

著者 (6件)： CHUNG Daehwan (Univ. Georgia, GA, USA) ,  FARKAS Joel (Univ. Georgia, GA, USA) ,  WESTPHELING Janet (Univ. Georgia, GA, USA) ,  CHUNG Daehwan (Oak Ridge National Lab., TN, USA) ,  FARKAS Joel (Oak Ridge National Lab., TN, USA) ,  WESTPHELING Janet (Oak Ridge National Lab., TN, USA)
資料名： Biotechnology for Biofuels (Web)  (Biotechnology for Biofuels (Web))
巻： 6  号： May  ページ： 6:82 (WEB ONLY)  発行年： 2013年05月 
JST資料番号： U7022A  ISSN： 1754-6834  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:好熱性微生物は,植物のバイオマスの燃料や化学物質への変換用の特別な利点がある。Caldicellulosiruptor属のメンバーは知られている最も好熱性のセルロース分解細菌である。80°C以上で様々な非前処理バイオマスの基質上に成長する能力を有し,一工程でバイオマスのバイオ製品への変換を約束する。望ましい形質を持つこのような比較的特徴のない生物に関して,遺伝的に操作する能力は,それらを有用にするための前提条件である。生成物の合成経路の代謝工学は,非前処理バイオマスを利用する能力の操作と比べて比較的簡単である。結果:ここでは,C.besciiのDNA形質転換への大きな障壁として存在する制限エンドヌクレアーゼをコードするcbeI(Cbes2438)の欠損の構築を報告する。これは,この属で相同組換により生成した標的染色体欠損の最初の例であり,結果の変異体JWCB018(ΔpyrFAΔcbeI)は,in vitroでメチル化することなく,大腸菌から単離されたDNAにより容易に形質転換される。PCR増幅および配列決定は欠損がそのまま隣接するメチルトランスフェラーゼ(Cbes2437)を残したことを示唆した。これをJWCB018から単離したDNAはCbeIとHaeIIIによる消化から保護されたという事実により確認した。C.hydrothermalis形質転換体から単離したプラスミドDNAは容易にC.besciiに形質転換した。9つの異なる制限エンドヌクレアーゼを用いた7つのCaldicellulosiruptor属から単離した染色体DNAの消化解析を,また,この属における機能的な制限-修飾活性を同定するために行った。結論:cbeI遺伝子の欠失は,日常的なC.besciiのDNA形質転換および染色体の改変に対する実質的な障壁を除く。これはバイオマスからのバイオ燃料およびバイオ製品の生産のための代謝工学と同様に遺伝子の機能解析を促進する。この属のメンバーにおける制限-修飾活性の解析は,この超好熱菌の重要なグループのDNA形質転換と遺伝子操作に対する障壁としての制限を除く道を示唆する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： Clostridium ,  内生胞子形成菌 ,  *形質転換 ,  *バイオマス ,  *遺伝子操作 ,  *DNA制限酵素 ,  *損失 ,  相同組換 ,  LOH【遺伝】 ,  染色体異常 ,  複合酵素系 ,  機能分析 ,  *高温菌
準シソーラス用語： Caldicellulosiruptor saccharolyti bescii ,  Caldicellulosiruptor saccharolyticus ,  機能解析 ,  *欠損 ,  *制限エンドヌクレアーゼ ,  制限-修飾系 ,  染色体欠損 ,  *代謝工学 ,  *超好熱菌

分類 (3件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  酵素の応用関連  (EB09100B) ,  生物燃料及び廃棄物燃料  (LB02020Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： 細菌 ,  Caldicellulosiruptor属 ,  DNA ,  形質転換 ,  障壁 ,  制限 ,  マーカー ,  置換