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J-GLOBAL ID：201302251390918574   整理番号：13A0409265

配列決定に基づくアプローチを用いたコムギ幼植物における低分子RNAおよびそれらの標的遺伝子のキャラクタリゼーション

Characterization of small RNAs and their target genes in wheat seedlings using sequencing-based approaches

著者 (4件)： LI Yong-fang (Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Oklahoma State Univ., Stillwater, OK 74078, USA) ,  ZHENG Yun (Inst. of Developmental Biology and Molecular Medicine School of Life Sciences, Fudan Univ., Shanghai 200433, CHN) ,  JAGADEESWARAN Guru (Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Oklahoma State Univ., Stillwater, OK 74078, USA) ,  SUNKAR Ramanjulu (Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Oklahoma State Univ., Stillwater, OK 74078, USA)
資料名： Plant Science  (Plant Science)
巻： 203-204  ページ： 17-24  発行年： 2013年04月 
JST資料番号： C0945B  ISSN： 0168-9452  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アイルランド (IRL)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コムギはその穀実生産のために世界中で最高級に栽培される植物種である。低分子RNA依存遺伝子制御がその生産性を含めて生活環の首尾良い完成に決定的であるので,コムギにおけるmiRNAsの同定のみならずそれらの標的の確認も重要である。コムギにおいてmiRNA標的と同様新規miRNAsを含む低分子RNAを同定するために,コムギ幼植物から低分子RNAおよびデグラドームライブラリーを構築した。低分子RNA分析は,32 miRNAファミリーに分類され得る新規miRNAを含むほとんどの保存RNAの同定につながった。配列分析はまた2つの豊富に発現されるrRNA由来低分子RNAのキャラクタリゼーションにつながった。miRNA標的を同定するために,デグラドームライブラリーが配列決定され,生物情報学的分析がmiRNAおよびTas3-siRNAの標的として53遺伝子を確認した。デグラドーム分析はまた多様な植物種においてsiRNA介在TAS3転写産物のサイレンシングによりTas3-siRNAの保存された精巧な調和機構を確認した。これらの知見は小麦における低分子RNA知識の基礎に更なる情報を追加した。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *コムギ ,  幼植物 ,  *RNA【核酸】 ,  アンチセンスRNA ,  遺伝学実験技術 ,  *遺伝子 ,  分子生物学 ,  siRNA ,  遺伝的調節 ,  生産 ,  穀粒 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： miRNA ,  ヌクレオチド配列決定 ,  作物生産 ,  *低分子RNA ,  転写後遺伝子サイレンシング ,  転写後調節 ,  *標的遺伝子 ,  分子生物情報学

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (5件)： コムギ ,  幼植物 ,  低分子RNA ,  標的遺伝子 ,  キャラクタリゼーション