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J-GLOBAL ID：201302253651339600   整理番号：13A1138498

Biographer SBGN対応生化学的ネットワークのウエブベースのエディティングおよびレンダリング

Biographer: web-based editing and rendering of SBGN compliant biochemical networks

著者 (7件)： KRAUSE Falko (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU) ,  SCHULZ Marvin (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU) ,  RIPKENS Ben (Codecentric AG, Duesseldorf, DEU) ,  FLOETTMANN Max (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU) ,  KRANTZ Marcus (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU) ,  KLIPP Edda (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU) ,  HANDORF Thomas (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 11  ページ： 1467-1468  発行年： 2013年06月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ネットワーク関連情報を扱うツールにライブラリーとして組み込まれる反応ネットワークのための,ウエブベースのレンダラーとエディターを開発した。本ソフトウエアにより,新しい標準的なSystems Biology Graphical Notation(SBGN)に基づいて可視化が可能で,SBMLやSBGN-MLなどの種々のフォーマットでコードされたネットワークを取り込むことができた。コアパッケージは,HTML5,CSSおよびJavaScriptにおいて実行され,どの種類のウエブベースのプロジェクト内でも利用可能で,双方向性のグラフ編集ツールおよび自動グラフレイアウトアルゴリズムが特徴であった。モデルのインポートとエクスポートおよび異なるフォーマットでの可視化のためのウエブサービスの様な拡張型の特徴を含む,スタンドアローンのグラフエディターとウエブサーバーが得られた。

シソーラス用語： *解析 ,  可視化 ,  グラフ ,  *生化学 ,  Web【情報システム】 ,  エディタ ,  レンダリング ,  生物学
準シソーラス用語： Biographer ,  システム生物学 ,  *ネットワーク分析

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 生化学 ,  ウエブ ,  エディティング ,  レンダリング