文献

J-GLOBAL ID：201302255126777100   整理番号：13A0766929

Drug-SNPing:SNPによる遺伝子タイピングのための薬物ベース,タンパク質相互作用ベースおよびtagSNPベースの統合型ファーマコゲノミクスプラットフォーム

Drug-SNPing: an integrated drug-based, protein interaction-based tagSNP-based pharmacogenomics platform for SNP genotyping

著者 (4件)： YANG Cheng-Hong (National Kaohsiung Univ. Applied Sci., Kaohsiung) ,  CHENG Yu-Huei (Toko Univ., Chiayi) ,  CHUANG Li-Yeh (I-Shou Univ., Kaohsiung) ,  CHANG Hsueh-Wei (Kaohsiung Medical Univ., Kaohsiung, TWN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 6  ページ： 758-764  発行年： 2013年03月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 薬物情報,タンパク質間相互作用,tagSNP選択および遺伝子タイピング情報の統合のためのプラットフォームとしての,ウエブベースのソフトウエアパッケージであるDrug-SNPingを開発した。Drugベースの入力データは,薬物の一般名,別名あるいは商品名,遺伝子名およびキーワードであった。PharmGKBベースの入力データは,遺伝子名,薬物名および疾患関連キーワードであった。得られた結果から,薬物に関連した情報,代謝酵素,薬物のターゲットおよびタンパク質相互作用データが得られた。遺伝子タイピング解析のために選択した遺伝子のtagSNPを検索したところ,全ての薬物ベースおよびタンパク質相互作用ベースのSNP遺伝子タイピング情報が,PCR-制限酵素断片長多型とTaqManプローブにより得られた。以上より,Drug-SNPingに薬物のキーワードや商品名を入力することにより,遺伝子タイピングやファーマコゲノミクスに関連する情報を直に得ることができることが示された。

シソーラス用語： 一塩基多型 ,  遺伝子型 ,  *プログラムパッケージ ,  薬物 ,  分子間相互作用 ,  *薬理学
準シソーラス用語： *Drug-SNPing ,  SNP ,  ソフトウェアパッケージ ,  *ファーマコゲノミクス ,  蛋白質相互作用

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： SNP ,  遺伝子タイピング ,  薬物 ,  タンパク質相互作用 ,  統合 ,  ファーマコゲノミクス ,  プラットフォーム