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J-GLOBAL ID：201302258540330400   整理番号：13A1784521

Oncofuse:遺伝子融合の発癌能の予測のための計算フレームワーク

Oncofuse: a computational framework for the prediction of the oncogenic potential of gene fusions

著者 (4件)： SHUGAY Mikhail (Univ. Navarra, Pamplona, ESP) ,  DE MENDIBIL Inigo Ortiz (Univ. Navarra, Pamplona, ESP) ,  VIZMANOS Jose L. (Univ. Navarra, Pamplona, ESP) ,  NOVO Francisco J. (Univ. Navarra, Pamplona, ESP)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 20  ページ： 2539-2546  発行年： 2013年10月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 染色体異常からもたらされる遺伝子融合は,重要な癌の原因である。今回,融合配列の分類のためのパイプライン,Oncofuseを開発し,発癌性融合遺伝子の遺伝的ホールマークを同定するために用いた。Oncofuseは新規な融合遺伝子の発癌能を予測し,既知の発癌融合に存在する様態に基づき,融合配列が発癌プロセスの促進物として振る舞うかの確率を計算した。バリデーションの結果は,Oncofuseが優れた正確さと再現性をもつことを確認した。Oncofuseは,癌患者の診断,分類及び治療において新規な融合遺伝子の同定の速度を速めるであろう。

シソーラス用語： *遺伝子融合 ,  癌腫 ,  *フレームワーク【ソフトウェア開発】 ,  分子生物学 ,  ゲノム ,  RNA【核酸】 ,  *発癌性 ,  分類 ,  予測 ,  自動分析計 ,  染色体 ,  融合タンパク質 ,  トランスクリプトーム ,  染色体異常 ,  確率 ,  同定
準シソーラス用語： *Oncofuse ,  ベイズ分類 ,  次世代シーケンサー ,  転写産物 ,  分子細胞遺伝学

分類 (3件)： 発癌機序・因子  (GE02020C) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  データベースシステム  (JD03030U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝子融合 ,  発癌能 ,  予測 ,  計算 ,  フレームワーク