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J-GLOBAL ID：201302260552363708   整理番号：13A1288494

Arabidopsis根における条件感受性オルタナティブスプライシングの全ゲノム検出

Genome-Wide Detection of Condition-Sensitive Alternative Splicing in Arabidopsis Roots

著者 (7件)： LI Wenfeng (Academia Sinica, Taipei, TWN) ,  LIN Wen-Dar (Academia Sinica, Taipei, TWN) ,  RAY Prasun (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma) ,  LAN Ping (Academia Sinica, Taipei, TWN) ,  SCHMIDT Wolfgang (Academia Sinica, Taipei, TWN) ,  SCHMIDT Wolfgang (National Chung Hsing Univ., Taichung, TWN) ,  SCHMIDT Wolfgang (National Taiwan Univ., Taipei, TWN)
資料名： Plant Physiology  (Plant Physiology)
巻： 162  号： 3  ページ： 1750-1763  発行年： 2013年07月 
JST資料番号： C0606A  ISSN： 0032-0889  CODEN： PLPHA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物は鉄(Fe)欠乏条件下では,代謝フラックスや細胞内Fe恒常性の調節によるFe欠乏緩和機構を持つ。前駆体mRNA(pre-mRNA)スプライシングパターンにおけるこの様な条件感受性変化を,トランスクリプトーム解析および新規の解析ツールRead Analysis & Comparison Kit in Java(RACKJ)を用いて調べた。オルタナティブスプライシング遺伝子では,ストレス関連遺伝子とオントロジー関連が多く,Fe欠乏によりその複雑性が増しており,Fe欠乏条件下での遺伝子活性化制御の複雑さが示された。また,リン酸欠乏植物との比較から,スプライシングパターン変化は栄養成分によるもので,確立的な変動ではないことが示唆された。本研究から,遺伝子発現や栄養成分誘発mRNA前駆体スプライシングの変化は,並列にしかし潜在的に相互作用していることが示唆された。

シソーラス用語： Arabidopsis ,  根 ,  感受性 ,  *選択的スプライシング ,  *ゲノム ,  検出 ,  鉄 ,  代謝 ,  mRNA ,  遺伝学実験技術 ,  解析 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子発現 ,  転写【遺伝】
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Arabidopsis ,  根 ,  感受性 ,  オルタナティブスプライシング ,  ゲノム