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J-GLOBAL ID：201302261298722910   整理番号：13A1443433

植物で分化した代謝における遺伝子発見のためのネットワーク分析

Network analysis for gene discovery in plant-specialized metabolism

著者 (3件)： HIGASHI Yasuhiro (RIKEN, Kanagawa, JPN) ,  SAITO Kazuki (RIKEN, Kanagawa, JPN) ,  SAITO Kazuki (Chiba Univ., Chiba, JPN)
資料名： Plant, Cell & Environment  (Plant, Cell & Environment)
巻： 36  号： 9  ページ： 1597-1606  発行年： 2013年09月 
JST資料番号： W0792A  ISSN： 0140-7791  CODEN： PLCEDV  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分化した代謝(二次代謝)に関与する遺伝子はしばしば転写段階で共発現するので,ウェブを利用したネットワーク分析によって発見されることが多い。ネットワーク分析はメタボロミクス調査や次世代シーケンシング法と組み合わせて使われることが多い。このような遺伝子発見は,とくにArabidopsis,トマトおよび多くの薬用植物で行われてきた。ウェブサイトの一覧表と相関ネットワークの可視化(図示)の4例を紹介した。

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *代謝 ,  ゲノム ,  *解析 ,  データマイニング ,  転写【遺伝】 ,  遺伝子発現 ,  調査 ,  自動分析計 ,  Arabidopsis ,  トマト ,  薬用植物 ,  生物学
準シソーラス用語： Web調査 ,  システム生物学 ,  *ネットワーク分析 ,  メタボロミクス ,  共発現 ,  次世代シーケンサー ,  植物ゲノム ,  *植物二次代謝 ,  *植物遺伝子

分類 (3件)： 物質の代謝  (EH02050Q) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 植物 ,  分化 ,  代謝 ,  遺伝子 ,  発見 ,  ネットワーク分析