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J-GLOBAL ID：201302265862323430   整理番号：13A1650963

サテライトDNA配列の電気泳動移動異常予測におけるDNA湾曲モデル能力の評価

Evaluation of DNA bending models in their capacity to predict electrophoretic migration anomalies of satellite DNA sequences

著者 (3件)： MATYASEK Roman (Inst. Biophysics, Acad. Sci. Czech Republic, Brno, CZE) ,  FULNECEK Jaroslav (Inst. Biophysics, Acad. Sci. Czech Republic, Brno, CZE) ,  KOVARIK Ales (Inst. Biophysics, Acad. Sci. Czech Republic, Brno, CZE)
資料名： Electrophoresis  (Electrophoresis)
巻： 34  号： 17  ページ： 2511-2521  発行年： 2013年09月 
JST資料番号： A0626B  ISSN： 0173-0835  CODEN： ELCTDN  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サテライトDNA配列の電気泳動移動異常予測におけるDNA湾曲モデルの能力を評価した。PAGEにおけるすべての単量体の遅延移動度は遅延係数1.02~1.54に相当した。2つのジヌクレオチドモデルではゲル移動度と湾曲予測が強い相関を示し,残りのジヌクレオチドモデルは配列部分集合のみで信頼できる中間予測結果をもたらした。実験の結果,適度な湾曲の天然配列の分析に適した汎用理論モデルを決定し,広いゲノム研究に適用することができた。ただし固有DNA湾曲の実験的測定の観点から,計算予測を考慮する必要があるものと考察した。

シソーラス用語： *SDS-PAGE ,  イオン移動度 ,  *サテライトDNA ,  *曲げ ,  ジヌクレオチド ,  計算モデル ,  係数 ,  ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  予測誤差 ,  性能評価
準シソーラス用語： DNA湾曲 ,  遅延係数

分類 (2件)： 電気泳動分析  (CC04017K) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (8件)： サテライト ,  DNA配列 ,  電気泳動 ,  予測 ,  DNA湾曲 ,  モデル ,  能力 ,  評価