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J-GLOBAL ID：201302265933512892   整理番号：13A1624522

主要な12種類のがんにおける突然変異の全体像とその意味

Mutational landscape and significance across 12 major cancer types

著者 (19件)： KANDOTH Cyriac (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  MCLELLAN Michael D. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  YE Kai (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  NIU Beifang (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  LU Charles (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  XIE Mingchao (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  ZHANG Qunyuan (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  MCMICHAEL Joshua F. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  WYCZALKOWSKI Matthew A. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  MILLER Christopher A. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  WENDL Michael C. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  LEY Timothy J. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  WILSON Richard K. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  DING Li (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  VANDIN Fabio (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  LEISERSON Mark D. M. (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  RAPHAEL Benjamin J. (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  WELCH John S. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA) ,  WALTER Matthew J. (Washington Univ. in St Louis, Missouri, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 502  号： 7471  ページ： 333-339  発行年： 2013年10月17日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： がんゲノムアトラス(TCGA)は,最新の塩基配列解読法および解析法を用い,数千の腫瘍について体細胞変異を明らかにした。本研究では,TCGA全がんエフォートの一環として,12種類の腫瘍に由来する3,281サンプルでの点突然変異と小規模な挿入と欠失に関するデータとその解析結果を示す。我々は12種類の腫瘍について横断的に,変異の頻度・タイプ・発生状況の分布を明らかにし,それらと原発組織,環境や発がん性物質の影響,DNA修復失敗との結びつきを確立した。さらに総合データセットを用いて,がんでよく知られている細胞過程(例えばMAPキナーゼ,ホスファチジルイノシトール3-OHキナーゼ,Wnt/β-カテニン,受容体型チロシンキナーゼが関わるシグナル伝達経路,あるいは細胞周期制御)や,新たに明らかになりつつある細胞過程(例えばヒストン,ヒストン修飾,スプライシング,代謝,タンパク質分解)から,有意な変異を起こした127個の遺伝子を明らかにした。これらの有意な変異を生じた遺伝子における変異の平均数は腫瘍の種類によって異なっていた。そして,ほとんどの腫瘍では2~6個の変異が見られることは,腫瘍形成に必要なドライバー変異の数が比較的少数であることを示している。転写因子や転写調節因子の変異には組織特異性が見られたが,ヒストン修飾因子では複数のがんタイプにわたって変異が多かった。臨床との関連解析では生存に有意に影響する遺伝子が見つかり,クローン/サブクローン構造に関する変異の解析では,腫瘍形成の際のそれらの時間的順序が明らかになった。まとめると,今回の結果は,新たな診断法の開発や,がん治療の個別化に対する基礎となるものといえる。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： *突然変異 ,  ゲノム ,  地図 ,  ヌクレオチド配列 ,  *腫瘍 ,  *点突然変異 ,  遺伝子欠損 ,  *細胞生理 ,  発癌物質 ,  DNA修復 ,  MAPキナーゼ ,  ホスファチジルイノシトール3-キナーゼ ,  タンパク質 ,  カテニン ,  転写因子 ,  受容体型チロシンキナーゼ ,  *細胞周期 ,  *経路 ,  *細胞情報伝達 ,  ヒストン ,  化学修飾 ,  RNAスプライシング ,  *遺伝子変異
準シソーラス用語： Wnt ,  βカテニン ,  アトラス ,  *シグナル伝達経路 ,  ヒストン修飾 ,  *腫瘍微環境 ,  *体細胞突然変異

分類 (3件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (3件)： がん ,  突然変異 ,  意味