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J-GLOBAL ID：201302269114067915   整理番号：13A0016626

Clostridium difficileにおけるグルコースおよび炭素制御因子CcpAによる大域的転写調節

Global transcriptional control by glucose and carbon regulator CcpA in Clostridium difficile

著者 (12件)： ANTUNES Ana (Inst. Pasteur) ,  CAMIADE Emilie (Inst. Pasteur) ,  MONOT Marc (Inst. Pasteur) ,  COURTOIS Emmanuelle (Inst. Pasteur) ,  COURTOIS Emmanuelle (Univ. Paris Diderot, Paris, FRA) ,  BARBUT Frederic (Inst. Pasteur) ,  SERNOVA Natalia V. (Inst. Information Transmission Problems, Russian Acad. Sci., Moscow, RUS) ,  RODIONOV Dmitry A. (Inst. Information Transmission Problems, Russian Acad. Sci., Moscow, RUS) ,  RODIONOV Dmitry A. (Sanford-Burnham Medical Res. Inst., CA, USA) ,  MARTIN-VERSTRAETE Isabelle (Inst. Pasteur) ,  MARTIN-VERSTRAETE Isabelle (Univ. Paris Diderot, Paris, FRA) ,  DUPUY Bruno (Inst. Pasteur)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 40  号： 21  ページ： 10701-10718  発行年： 2012年11月30日 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全トランスクリプトーム解析により,Clostridium difficileにおけるグルコース依存性およびCcpA依存性遺伝子調節を特性化した。C.difficile遺伝子の18%はグルコースにより調節され,グルコースに対する調節に対しCcpAに依存していた。CcpAレギュロンは糖取込,発酵およびアミノ酸代謝の関わる遺伝子から成り,炭素および窒素経路間の結合としてのCcpAの役割を確認した。クロマチン免疫沈降およびゲノム配列解析の組合せを用いて,CcpAにより直接制御されている遺伝子に対応する55のCcpAを検出した。C.difficile CcpAコンセンサス結合部位を規定した。電気泳動移動度シフトアッセイにより,標的コンセンサス結合部位へのCcpA蛋白質の結合を示した。

シソーラス用語： *単糖類 ,  *炭素 ,  *タンパク質 ,  転写【遺伝】 ,  遺伝学実験技術 ,  解析 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子 ,  レギュロン ,  炭水化物 ,  発酵 ,  アミノ酸代謝 ,  窒素 ,  免疫沈降反応 ,  クロマチン ,  ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  結合部位 ,  ゲル電気泳動 ,  ヘキソース ,  アルドース ,  *CcpA ,  ゲノム配列 ,  コンセンサス配列 ,  トランスクリプトーム解析 ,  *転写調節 ,  糖 ,  *Clostridioides difficile ,  *遺伝子発現調整 ,  クロマチン免疫沈降反応 ,  電気泳動移動度アッセイ ,  バイオアッセイ ,  イムノアッセイ ,  *微生物 ,  *クロストリジウム属 ,  *芽胞形成菌 ,  *バシラス科 ,  *遺伝
準シソーラス用語： *Clostridium difficile ,  *遺伝的調節 ,  クロマチン免疫沈降 ,  遺伝子調節 ,  電気泳動移動度シフトアッセイ

分類 (6件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  単糖類  (CF10052H) ,  無機化合物一般及び元素  (CD01010D) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： グルコース

タイトルに関連する用語 (6件)： Clostridium ,  グルコース ,  炭素 ,  制御因子 ,  CCPA ,  転写調節