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J-GLOBAL ID：201302270947550510   整理番号：13A1855648

ナノ閉じ込めダンベルとしての解析に用いる巨大DNA分子の提示

Presentation of Large DNA Molecules for Analysis as Nanoconfined Dumbbells

著者 (7件)： KOUNOVSKY-SHAFER Kristy L. (Univ. Wisconsin - Mdison, Wisconsin, USA) ,  HERNANDEZ-ORTIZ Juan P. (Univ. Wisconsin - Mdison, Wisconsin, USA) ,  HERNANDEZ-ORTIZ Juan P. (Universidad Nacional de Colombia, Medellin Colombia) ,  JO Kyubong (Sogang Univ., Seoul, KOR) ,  ODIJK Theo (Univ. Leiden, Delft Univ. Technol., Leiden, NLD) ,  DE PABLO Juan J. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  SCHWARTZ David C. (Univ. Wisconsin - Mdison, Wisconsin, USA)
資料名： Macromolecules  (Macromolecules)
巻： 46  号： 20  ページ： 8356-8368  発行年： 2013年10月22日 
JST資料番号： B0952A  ISSN： 0024-9297  CODEN： MAMOBX  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 巨大DNA分子の解析により段階的な配列情報が得られるが,それらを効果的に提示する方法が必要である。本報では,分子シミュレーションを用いて,分子的に閉じ込めたナノスケールのスリット中で,巨大DNA分子の分子鎖形状を提示するため,効率的で拡張性の高い方法を開発したので報告した。この方法では,DNA分子が完全に輪郭長さに相当する延伸配座を得るため,光学顕微鏡法による解析が可能になった。ナノスリット中のDNA分子配座と動力学を説明する分子モデルを提案し,シミュレーションによって静電気と水力学的相互作用間のバランスが分子配座に影響を及ぼすことを示した。

シソーラス用語： ナノ構造 ,  *空間 ,  *分子鎖 ,  *van der Waals半径 ,  立体配座 ,  *DNA【核酸】 ,  *分子運動 ,  間隙 ,  モデリング ,  分子構造 ,  *計算機シミュレーション ,  静電相互作用 ,  イオン強度
準シソーラス用語： スリット【構造】 ,  分子モデリング ,  分子間空洞 ,  分子鎖運動 ,  分子鎖緩和 ,  *分子鎖空間 ,  分子鎖張力 ,  *分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  高分子の立体構造  (CG02031G)

タイトルに関連する用語 (5件)： 閉じ込め ,  ダンベル ,  解析 ,  DNA ,  分子