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J-GLOBAL ID：201302275386573046   整理番号：13A0479606

膜結合チトクロームb₅に対するアミド-¹⁵N化学シフト異方性テンソルの量子化学計算

Quantum Chemical Calculations of Amide-¹⁵N Chemical Shift Anisotropy Tensors for a Membrane-Bound Cytochrome-b₅

著者 (2件)： PANDEY Manoj Kumar (Univ. Michigan, Michigan, USA) ,  RAMAMOORTHY Ayyalusamy (Univ. Michigan, Michigan, USA)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 117  号： 3  ページ： 859-867  発行年： 2013年01月24日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生体分子のアミド-¹⁵N化学シフト異方性(CSA)テンソルを決定して,構造と動力学研究に対するそれらの変化を理解することにかなりの関心がある。膜結合チトクロームb₅(cytb₅)由来のCSAテンソル測定に関連した溶液と固相NMR分光法と量子化学計算を用いる膜蛋白質に由来する困難性により,NMRに基づく構造研究がモデル系,典型的にはモデルペプチドの単結晶から決定できるCSAテンソルに極めて依存した。ここでは,膜蛋白質とヘム含有蛋白質及びチトクロームb₅-P450のような膜結合蛋白質-蛋白質複合体の構造と動力学を調べる脈絡で,16.7kDa膜結合常磁性ヘム含有蛋白質,cytb₅に対する密度汎関数理論を用いて主鎖アミド-¹⁵N CSAテンソル主成分を決定した。関心事のアミド-¹⁵N核から5Å距離内のアミノ酸残基を取り上げてすべての計算を行った。計算主鎖アミド-¹⁵N CSAスパンは最少遮蔽成分(δ₁₁)がN-H結合を作る有効核間距離r_N-H=1.023Åと一定角度β=18°に対して決定したこの液相NMRデータとあまり良く一致しなかった。量子化学計算を用いて得たアミド-¹⁵N CSAスパンの変化は液相NMR測定から得たアミド-¹⁵N CSAスパンの変化よりも小さいことを見いだし,一方,その変化傾向は良く一致していた。

シソーラス用語： *チトクロームb5 ,  *細胞結合 ,  *化学シフト ,  *C-N結合 ,  異方性 ,  テンソル ,  膜タンパク質 ,  モデル化合物 ,  単結晶 ,  高分子量 ,  常磁性 ,  密度汎関数法 ,  基底関数系 ,  主成分分析 ,  アミノ酸残基 ,  チトクロームP450 ,  タンパク質複合体 ,  核間距離 ,  ab initio法 ,  窒素15NMR ,  液相 ,  固相 ,  等方性 ,  末端基 ,  ヘリックス構造 ,  β構造 ,  線形性 ,  アミノ酸配列 ,  アミノ基 ,  化学結合 ,  スパン
準シソーラス用語： CYP450 ,  C末端 ,  C末端領域 ,  N-H結合 ,  αヘリックス ,  βシート構造 ,  アミド結合 ,  生体分子 ,  線形相関 ,  膜結合 ,  密度汎関数理論 ,  量子化学計算

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  有機化合物のNMR  (BM07044Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 膜結合 ,  チトクロームb5 ,  アミド ,  化学シフト ,  異方性 ,  テンソル ,  量子化学計算