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J-GLOBAL ID：201302275925400347   整理番号：13A1156830

更新世中期初頭のウマのゲノム塩基配列を用いたウマ属進化の再検討

Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse

著者 (40件)： ORLANDO Ludovic (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  GINOLHAC Aurelien (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  SCHUBERT Mikkel (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  CAPPELLINI Enrico (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  VILSTRUP Julia T. (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  RAGHAVAN Maanasa (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  KORNELIUSSEN Thorfinn (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  MALASPINAS Anna-Sapfo (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  STENDERUP Jesper (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  VELAZQUEZ Amhed M. V. (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  RASMUSSEN Morten (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  SEGUIN-ORLANDO Andaine (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  MORTENSEN Cecilie (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  MAGNUSSEN Kim (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  GREGERSEN Kristian (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  KROGH Anders (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  GILBERT M. Thomas P. (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  KJAER Kurt (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  WILLERSLEV Eske (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  ZHANG Guojie (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Xiaoli (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  MIN Jiumeng (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Jun (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  FROESE Duane (Univ. Alberta, Alberta, CAN) ,  ALBRECHTSEN Anders (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  MOLTKE Ida (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  STILLER Mathias (Univ. California, Santa Cruz, California, USA) ,  CAHILL James (Univ. California, Santa Cruz, California, USA) ,  SHAPIRO Beth (Univ. California, Santa Cruz, California, USA) ,  PETERSEN Bent (Technical Univ. Denmark, Lyngby, DNK) ,  VOGT Josef (Technical Univ. Denmark, Lyngby, DNK) ,  BRUNAK Soren (Technical Univ. Denmark, Lyngby, DNK) ,  SICHERITZ-PONTEN Thomas (Technical Univ. Denmark, Lyngby, DNK) ,  MOLTKE Ida (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  JOHNSON Philip L. F. (Emory Univ., Georgia, USA) ,  FUMAGALLI Matteo (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  SZKLARCZYK Damian (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  KELSTRUP Christian D. (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  JENSEN Lars Juhl (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  OLSEN Jesper V. (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 499  号： 7456  ページ： 74-78  発行年： 2013年07月04日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウマ科動物は化石記録が豊富なため,進化の過程のモデルとなっている。本論文では,約78万~56万年前の永久凍土層から発掘されたウマの骨に由来する,カバー率1.12倍の概要ゲノムについて報告する。このデータは,これまでに配列解読された中で年代的に最古の全ゲノム塩基配列であり,従来の最古の年代をほぼ1桁さかのぼる。比較のため,更新世後期(4万3000年前)のウマ,現生の家畜ウマ(Equus ferus caballus)の5品種,モウコノウマ(E.f.przewalskii),およびロバ(E.asinus)に関してもゲノム塩基配列の解読を行った。分析の結果,現代のウマ,シマウマおよびロバの全ての起源となるウマ属(Equus)系統が生じたのは450万~400万年前であることが示唆された。これは,ウマ属の最終共通祖先に関して従来認められてきた年代値の2倍の古さである。また,ウマ集団のサイズが過去200万年の間にたびたび変動し,特に過酷な気候変動のあった期間にサイズ変動が見られることもわかった。モウコノウマと家畜ウマの集団は7万2000~3万8000年前に分岐したと推定され,研究対象とした家畜ウマ品種とモウコノウマとが最近混合した証拠は認められなかった。このことは,モウコノウマが最後の現存する野生ウマ集団であるという主張の裏付けとなる。モウコノウマ集団と家畜ウマ集団に同等レベルの遺伝的変動が認められたことから,モウコノウマは遺伝的に存続能力があり,保護活動に値すると考えられる。また,ウマの進化の過程を通じて,免疫系および嗅覚に対し持続的な選択がかかってきたことを示す証拠も得られた。さらに,ウマ品種には,中立から乖離し,モウコノウマと比較して低レベルの遺伝的変動を示すゲノム領域が29か所見つかった。こうした領域は,家畜化過程の早期に選択された遺伝子座に対応している可能性がある。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： 更新世 ,  ゲノム ,  *ウマ ,  *分子進化 ,  家畜 ,  野生動物 ,  品種 ,  遺伝子座 ,  種差 ,  ヌクレオチド配列 ,  系統発生 ,  系統樹 ,  集団遺伝 ,  遺伝

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 更新世中期 ,  ウマ ,  ゲノム ,  塩基配列 ,  ウマ属 ,  進化