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J-GLOBAL ID：201302276742166325   整理番号：13A0094907

細菌のキチン分解群集は土壌のキチンとpH変化に応答する

Bacterial Chitinolytic Communities Respond to Chitin and pH Alteration in Soil

著者 (5件)： KIELAK Anna M. (Univ. Groningen, Groningen, NLD) ,  CRETOIU Mariana Silvia (Univ. Groningen, Groningen, NLD) ,  SEMENOV Alexander V. (Univ. Groningen, Groningen, NLD) ,  SORENSEN Soren J. (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  VAN ELSAS Jan Dirk (Univ. Groningen, Groningen, NLD)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 79  号： 1  ページ： 263-272  発行年： 2013年01月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 土壌を改良するキチンが土壌の植物病原体を抑制する可能性があるので,土壌へのキチンの添加に対する影響を調べるために,弱酸性土壌下でキチンのレベルとpHを変化させて実験を行った。キチナーゼの活性実験により,7日目に酵素活性がピークに達し,添加した天然キチンに対する応答が速いことが明らかになった。PCR-変性グラジエントゲル電気泳動(DGGE)に基づく16SrRNAとchiA遺伝子の解析から,キチンの添加とpHの変化に対して,細菌群集は系統及び機能に基づいて構造が変化することが示された。系統学的解析より,土壌におけるchiA遺伝子の系統がかなり多様であること,そして異なるchiA遺伝子の系統は様々な幅広い土壌pH値においてキチンの添加により選択されることが示唆された。また,キチンの添加に対する速い応答には,グラム陰性菌が強く寄与し,放線菌はあまり寄与していないことが示唆された。本結果は土壌細菌群集のキチンに対する応答について理解を深めるものであり,キチンによる土壌の抑制性の理解と新奇酵素の発掘に対して有用なものである。

シソーラス用語： *キチン ,  *土壌細菌 ,  pH依存性 ,  グラム陰性菌 ,  放線菌類 ,  生物分解 ,  rRNA ,  *グリコシド結合ヒドロラーゼ ,  PCR法 ,  ゲル電気泳動 ,  遺伝学 ,  N-アセチルグルコサミニダーゼ ,  経時変化 ,  *ミクロフローラ ,  生物多様性
準シソーラス用語： 16S rRNA ,  PCR-DGGE法 ,  キトビオシダーゼ ,  *チキナーゼ ,  メタゲノム解析

分類 (3件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  土壌生物  (FB04050N) ,  代謝と栄養  (EG03054K)

タイトルに関連する用語 (7件)： 細菌 ,  キチン ,  分解 ,  群集 ,  土壌 ,  pH ,  応答