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J-GLOBAL ID：201302278286962907   整理番号：13A0366188

量的形質の解析に使用できる,酵母プロテオームの完全な質量分析マップ

A complete mass-spectrometric map of the yeast proteome applied to quantitative trait analysis

著者 (24件)： PICOTTI Paola (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  ROEST Hannes (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  RINNER Oliver (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  REITER Lukas (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  SHEN Qin (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  FREI Andreas (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  WOLLSCHEID Bernd (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  AEBERSOLD Ruedi (ETH Zurich, Zurich, CHE) ,  CLEMENT-ZIZA Mathieu (Technische Univ. Dresden, Dresden, DEU) ,  MICHAELSON Jacob J. (Technische Univ. Dresden, Dresden, DEU) ,  BEYER Andreas (Technische Univ. Dresden, Dresden, DEU) ,  LAM Henry (Hong Kong Univ. Sci. and Technol., HKG) ,  CAMPBELL David S. (Inst. for Systems Biology, Washington, USA) ,  DEUTSCH Eric W. (Inst. for Systems Biology, Washington, USA) ,  SUN Zhi (Inst. for Systems Biology, Washington, USA) ,  KUSEBAUCH Ulrike (Inst. for Systems Biology, Washington, USA) ,  MORITZ Robert L. (Inst. for Systems Biology, Washington, USA) ,  SCHMIDT Alexander (Univ. Basel, Basel, CHE) ,  RINNER Oliver (Biognosys AG, Zurich, CHE) ,  REITER Lukas (Biognosys AG, Zurich, CHE) ,  SHEN Qin (Shanghai Inst. for Biological Sci., Chinese Acad. of Sci., Shanghai, CHN) ,  ALBERTI Simon (Max Planck Inst. of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, DEU) ,  AEBERSOLD Ruedi (Competence Center for Systems Physiology and Metabolic Diseases, Zurich, CHE) ,  AEBERSOLD Ruedi (Univ. Zurich, Zurich, CHE)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 494  号： 7436  ページ： 266-270  発行年： 2013年02月14日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 研究中の系の成分についてのアクセス可能で完全な参照マップは,非常に有用な研究手段となることが,生命科学のさまざまな分野での実験から示唆されている。このようなマップの例としては,分子の分光学的特性に関するライブラリーや分析化学,法化学における薬物構造データベースなどが挙げられる。こうしたマップやそれを活用する手法は,どのような試料についてもマップに含まれる分子の存在や量を調べられる信頼性の高い測定法で成り立っている。これまでのところ,プロテオームについてこのようなマップを作成しようとする試みは,いずれもプロテオームを完全に網羅するところまでは達していない。今回我々は,ハイスループットペプチド合成と質量分析法に基づく戦略を使って,出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)プロテオームのほぼ完全な参照マップ(ゲノムから推定されるタンパク質の約97%を網羅)を作成した。作製された質量分析マップは2種類で,1つは発見型研究(ショットガン法による),もう1つは仮説主導型研究(ターゲット法による)プロテオーム解析に適している。この2種類のマップを合わせれば,現在のプロテオミクス技術で行われる研究の大部分に役立つ,完全なプロテオーム測定法がそろうことになる。このマップの有用性を明らかにするため,これを用いてタンパク質の量的形質遺伝子座(QTL)解析を行った。QTL解析では,膨大な数の試料について,同一のペプチド群を正確に測定する必要がある。78株を超える酵母でタンパク質の測定を行い,独立した遺伝子座間に,関連タンパク質の量に影響を及ぼす複雑な関係があることが明らかになった。これらの結果は,タンパク質レベルを適応変化させるが,機能的に関連した経路に含まれるタンパク質の化学量論的関係は維持するような多型セットの獲得が,選択圧によって起こりやすくなることを示唆している。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： *プロテオーム ,  質量分析 ,  Saccharomyces cerevisiae ,  微生物タンパク質 ,  プロテオミクス ,  *量的形質遺伝子座 ,  化学量論 ,  ペプチド合成 ,  形質発現

分類 (1件)： 微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 量的形質 ,  解析 ,  酵母 ,  プロテオーム ,  質量分析 ,  マップ