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J-GLOBAL ID：201302279217451204   整理番号：13A0762886

インデックスに基づくスクリーニング法による迅速な蛋白質結合部位の比較

Fast Protein Binding Site Comparison via an Index-Based Screening Technology

著者 (6件)： BEHREN Mathias M. von (Univ. Hamburg, Hamburg, DEU) ,  VOLKAMER Andrea (Univ. Hamburg, Hamburg, DEU) ,  HENZLER Angela M. (Univ. Hamburg, Hamburg, DEU) ,  SCHOMBURG Karen T. (Univ. Hamburg, Hamburg, DEU) ,  URBACZEK Sascha (Univ. Hamburg, Hamburg, DEU) ,  RAREY Matthias (Univ. Hamburg, Hamburg, DEU)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 53  号： 2  ページ： 411-422  発行年： 2013年02月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 迅速な蛋白質結合部位比較および機能予測に対する,新しいインデックスに基づく方法,TrixPを示した。TrixPは,ファーマコフォアおよび空間的特徴をコードする,記述子の比較に基づき,結合部位類似性を決定する。TrixPは,部分的な形状のマッチング法を用い,蛋白質の固有の柔軟性を説明する。TrixPは,結合部位を重ね合わせ,ファーマコフォア性質の適合に従い,類似性を評価する。TrixPは,密接に関係した結合部位とあまり関係のない結合部位の間の類似性も見出すことができる。30種類の予測されるキナーゼ結合部位を,完全にそれらの既知サブファミリーに分類できた。

シソーラス用語： *結合部位 ,  *タンパク質結合 ,  マッチング ,  統制索引語 ,  特性 ,  *スクリーニング ,  類似性 ,  *分子認識
準シソーラス用語： 特徴マッチング ,  分子記述子 ,  空間特性 ,  *薬物スクリーニング ,  分子類似性

分類 (2件)： 薬物学一般  (GV01010J) ,  パターン認識  (JE07000S)

タイトルに関連する用語 (4件)： インデックス ,  スクリーニング法 ,  蛋白質 ,  結合部位