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J-GLOBAL ID：201302283459450358   整理番号：13A1692760

明示水中ペプチド-グラフェン相互作用のシミュレーション

Simulations of Peptide-Graphene Interactions in Explicit Water

著者 (3件)： CAMDEN Aerial N. (Air Force Res. Lab., Ohio, USA) ,  BARR Stephen A. (Air Force Res. Lab., Ohio, USA) ,  BERRY Rajiv J. (Air Force Res. Lab., Ohio, USA)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 117  号： 37  ページ： 10691-10697  発行年： 2013年09月19日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 古典的分子動力学(MD)シミュレーションを用い,ペプチド鎖部分でない分離したアミノ酸と対照的にペプチド中のアミノ酸残基とグラフェンの相互作用を調べた。また,グラフェンがペプチド構造と立体配座に及ぼす効果を決定するためMDトラジェクトリーを調べた。この方法は分子水準で結合機構に洞察を提供した。個別残基の計算した表面相互作用は粗粒モデルをパラメタリゼーションするため有用であり,モデルは一層長い時間と長さ規模にシミュレーションを拡張することを可能にした。このようなモデルは特別仕立ての生化学センサに対する一層大きなペプチド配列の迅速計算機利用スクリーニングを容易にした。

シソーラス用語： *トリペプチド ,  *炭素材 ,  *表面改質 ,  *分子間相互作用 ,  エンタルピー ,  ポテンシャルエネルギー ,  水分子 ,  溶媒効果 ,  相互作用パラメータ ,  親水性 ,  疎水性 ,  立体配座 ,  アミノ酸残基 ,  アミノ酸配列 ,  パラメタリゼーション ,  計算機利用 ,  スクリーニング ,  バイオセンサ ,  化学センサ ,  量子論 ,  分子動力学 ,  計算機シミュレーション ,  分子構造 ,  トラジェクトリー ,  古典解 ,  グラフェン
準シソーラス用語： 古典的解 ,  成分分析 ,  生体分子 ,  粗粒モデル ,  表面修飾 ,  分子動力学シミュレーション ,  量子力学 ,  ペプチド構造 ,  ペプチド配列 ,  ペプチド立体配座

分類 (2件)： 無機化合物一般及び元素  (CD01010D) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (4件)： Gly-Ala-Gly-OH ,  Gly-Gly-Gly-OH ,  Gly-Gln-Gly-OH ,  Gly-Tyr-Gly-OH

タイトルに関連する用語 (5件)： 水中 ,  ペプチド ,  グラフェン ,  相互作用 ,  シミュレーション