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J-GLOBAL ID:201302285865963113   整理番号:13A0627324

異なった数のクエリ構造を用いた化学的類似性測度の比較

Comparison of chemical similarity measures using different numbers of query structures
著者 (3件):
資料名:
巻: 39  号:ページ: 7-14  発行年: 2013年02月 
JST資料番号: D0619B  ISSN: 0165-5515  CODEN: JISCDI  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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Sheffield等が用いた,化学構造データベース探索に対して用いたテストコレクションの修正形は,化学情報学において重要な部分であり,初期には類似性探索において,引き続いて仮想スクリーニングとして知られる方法全般に広く採用された。本論文では,化学情報学の意味で従来研究されなかったテストコレクションの1つの側面について,特に化学データベース探索に対する異なった類似性測度の相対的利点に関するロバスト記述に必要なクエリ数について調べた。MDL薬物データ報告による実験を行った。異なったタイプの類似性測度の比較は,仮想スクリーニングへの研究の重要な側面であった。従来の比較研究は,限られた数のクエリ分子のみを用いたが,本実験による結果は,従来は理想から遠く,6タイプの生物活性各々に対して,クエリ分子の全集合を用いて得た結果を密接に反映するために数100のクエリ分子が必要であることを示した。
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