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J-GLOBAL ID：201302288309824421   整理番号：13A0642694

rBiopaxParser BioPAXデータを解析,修飾そして可視化するためのRパッケージ

rBiopaxParser-an R package to parse, modify and visualize BioPAX data

著者 (5件)： KRAMER Frank (Univ. Medical Center Goettingen, Goettingen, DEU) ,  BAYERLOVA Michaela (Univ. Medical Center Goettingen, Goettingen, DEU) ,  KLEMM Florian (Univ. Medical Center Goettingen, Goettingen, DEU) ,  BLECKMANN Annalen (Univ. Medical Center Goettingen, Goettingen, DEU) ,  BEISSBARTH Tim (Univ. Medical Center Goettingen, Goettingen, DEU)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 4  ページ： 520-522  発行年： 2013年02月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： rBiopaxParserは,統計分析環境R内の生物経路交換(BioPAX)言語による経路データを分析,俯瞰,修飾するための包括的な機能セットを提供するソフトウェアパッケージである。これらの機能により,BioPAXモデルの特定の部分にアクセスし修飾することが可能となる。また,相互作用を制御する調節グラフを展開し,BioPAX経路を可視化することも可能となる。rBiopaxParserはオープンソースRパッケージであり,Bioconductorに提出済みである。

シソーラス用語： 可視化 ,  代謝経路 ,  *プログラムパッケージ ,  ソフトウェア
準シソーラス用語： *rBiopaxParser ,  オープンソースソフトウェア ,  ソフトウェアパッケージ

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 解析 ,  修飾 ,  可視化 ,  Rパッケージ