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J-GLOBAL ID：201302288585969948   整理番号：13A0254610

Bacillus licheniformis,Pseudomonas stutzeri,Streptococcus pyogenesおよびStaphylococcus aureusのタイプ2IDI酵素を治療ターゲットとする阻害剤候補の仮想スクリーニングのための計算機モデリング

In silico modeling of the type 2 IDI enzymes of Bacillus licheniformis, Pseudomonas stutzeri, Streptococcus pyogenes, and Staphylococcus aureus for virtual screening of potential inhibitors of this therapeutic target

著者 (4件)： TORKTAZ Ibrahim (Dep. of Molecular Genetics, National Inst. of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), Tehran 14155-6343, IRN) ,  TORKTAZ Ibrahim (Dep. of Biotechnology, Fac. of Advanced Sci. and Technologies, Univ. of Isfahan, Isfahan 81746-73441, IRN) ,  SHAHBANI ZAHIRI Hossein (Dep. of Molecular Genetics, National Inst. of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), Tehran 14155-6343, IRN) ,  AKBARI NOGHABI Kambiz (Dep. of Molecular Genetics, National Inst. of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), Tehran 14155-6343, IRN)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 39  ページ： 176-182  発行年： 2013年02月 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イソペンテニル二リン酸イソメラーゼはイソプレノイドの産生をメバロナート経路に依存する連鎖球菌属およびぶどう球菌属の病原体種などの生物に必須の酵素である。これらの病原体はタイプ1IDIを含むヒトとは異なり2種のIDIを含むので,タイプ2IDIはいくつかの感染病の治療の重要なターゲットと考えられる。本研究はドッキング仮想スクリーニングによりCoCoCoライブラリからの2000種の化学種からタイプ2IDI選択的阻害剤を探索した。Bacillus licheniformis,Pseudomonas stutzeri,Streptococcus pyogenes,およびStaphylococcus aureusのタイプ2IDIの構造を比較モデリングおよび隠蔽Markovモデル(HMM)に基づく予測によりモデル化した。予測したモデルをQ平均およびProsaスコアにより評価した。MolDockスコアリング関数を用いるMolegro仮想ドッカーを用い,選定した阻害剤のモデル活性点に対する結合親和性を測定した。あわせて化合物の阻害効果をSulfolobus shibataeおよびThermus thermophilusのタイプ2IDIおよび大腸菌のタイプ1 IDIの結晶構造について仮想試験した。最後に発見した阻害剤の阻害効果をヒトのタイプ1IDIにつき仮想試験した。その結果,興味あることに,阻害剤は細菌のIDI,特にタイプ2と効率的に結合し阻害するのに対し,ヒトIDIを阻害しないことが推定された。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *多重結合イソメラーゼ ,  *酵素阻害剤 ,  結晶構造 ,  Bacillus licheniformis ,  Pseudomonas ,  溶血性連鎖球菌 ,  黄色ぶどう球菌 ,  ドッキング ,  親和性 ,  Sulfolobus ,  Thermus thermophilus ,  ヒト ,  選択性 ,  *抗細菌薬 ,  錯体生成 ,  分子化合物 ,  *基質特異性 ,  分子認識
準シソーラス用語： Pseudomonas stutzeri ,  Staphylococcus aureus ,  Streptococcus pyogenes ,  Sulfolobus shibatae ,  イソペンテニル二リン酸イソメラーゼ ,  結合親和性 ,  抗菌剤

分類 (4件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  抗細菌薬の基礎研究  (GW17020S) ,  分子化合物  (CE02000C) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (10件)： Bacillus ,  Pseudomonas ,  Streptococcus ,  Staphylococcus ,  タイプ ,  酵素 ,  治療ターゲット ,  阻害剤 ,  仮想スクリーニング ,  計算機モデリング