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J-GLOBAL ID：201302289923045648   整理番号：13A0766940

SwarmDock:柔軟な蛋白質-蛋白質ドッキングのためのサーバ

SwarmDock: a server for flexible protein-protein docking

著者 (5件)： TORCHALA Mieczyslaw (Cancer Res. UK London Res. Inst., London, GBR) ,  MOAL Iain H. (Barcelona Supercomputing Center, Barcelona, ESP) ,  CHALEIL Raphael A. G. (Cancer Res. UK London Res. Inst., London, GBR) ,  FERNANDEZ-RECIO Juan (Barcelona Supercomputing Center, Barcelona, ESP) ,  BATES Paul A. (Cancer Res. UK London Res. Inst., London, GBR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 6  ページ： 807-809  発行年： 2013年03月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 柔軟な蛋白質-蛋白質ドッキングアルゴリズムであるSwarmDockを内包および拡張したウェブサーバを提示した。結合相手のPDBファイルをアップロードすると,サーバは低エネルギー立体配座を生成すると共に,クラスタ化されたドッキングリストと対応構造を返す。ユーザは完全包括的なドッキングや結合に関与する特別な残基に着目したドッキングを実施できる。最近のドッキングベンチマークに対して実験したところ,最高の実効性能が得られた。

シソーラス用語： *ドッキング ,  タンパク質結合 ,  *計算機システム ,  立体配座 ,  クラスタ化 ,  ベンチマーク ,  アミノ酸残基 ,  アルゴリズム ,  柔軟性
準シソーラス用語： *SwarmDock ,  *ウェブサーバ

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質 ,  蛋白質ドッキング ,  サーバ