文献

J-GLOBAL ID：201302292853315406   整理番号：13A1197148

培養分離菌の配列決定及び増幅rRNA限定分析により農業副産物コンポストにおける細菌多様性の検証

Assessment of bacterial diversity in agricultural by-product compost by sequencing of cultivated isolates and amplified rDNA restriction analysis

著者 (3件)： CHANDNA Piyush (Univ. of Delhi South Campus, Lignocellulose Biotechnology Lab., Dep. of Microbiology, 110 021, New Delhi, IND) ,  MALLIK Sarita (Indiana Univ., Dep. of Biology, 47405, Bloomington, IN, USA) ,  KUHAD Ramesh Chander (Univ. of Delhi South Campus, Lignocellulose Biotechnology Lab., Dep. of Microbiology, 110 021, New Delhi, IND)
資料名： Applied Microbiology and Biotechnology  (Applied Microbiology and Biotechnology)
巻： 97  号： 15  ページ： 6991-7003  発行年： 2013年08月 
JST資料番号： H0764A  ISSN： 0175-7598  CODEN： EJABDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コンポストにおける細菌多様性の調査はその系統発生を明らかとするため分子クロノメータを用いて行った。コンポストから分離した33種類の細菌分離菌は16S rRNA遺伝子配列決定により分析し,Bacillus,γ,β-プロテオバクテリア,及びActinobacteriaの系統関係を明らかとした。これら系統中,Bacillusに属する分離菌はStaphylococcus,Bacillus,Terribacillus,及びLysinibacillus種から構成された。Actinobacteria系統からMicrobacterium barkeri及びKocuria sp.を同定した。他の細菌群はComamonas及びAcidovorax属系統を示した。類似の分離菌はARDRAを通して分析した。各分離菌由来の16S rRNA遺伝子の増幅産物は酵素HpaII,HinfI,及びMspIにより分離し解析した。ARDRA型の数学的解析から細菌多様性の特性化に対する十分な系統情報を得た。Copyright 2012 Springer-Verlag Berlin Heidelberg Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 系統発生 ,  測時機 ,  副産物 ,  *堆肥 ,  *生物多様性 ,  ヌクレオチド配列 ,  rRNA ,  *rRNA遺伝子 ,  桿菌属 ,  細菌 ,  ぶどう球菌属 ,  系統樹 ,  遺伝子操作 ,  リボソーム ,  制限酵素地図
準シソーラス用語： *16S rRNA遺伝子 ,  Actinobacteria ,  ARDRA ,  Bacillus ,  Staphylococcus ,  βプロテオバクテリア ,  γプロテオバクテリア ,  クロノメータ ,  *コンポスト ,  遺伝子配列 ,  *細菌多様性 ,  農業副産物

分類 (3件)： 農業廃棄物一般  (FB07010Q) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 培養 ,  分離菌 ,  増幅 ,  rRNA ,  分析 ,  農業副産物 ,  コンポスト ,  細菌多様性 ,  検証