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J-GLOBAL ID：201302292858960474   整理番号：13A0283069

理論シミュレーションによって予測した光開裂テトラペプチドの折畳み動力学と赤外スペクトル

The Folding Dynamics and Infrared Spectra of a Photocleaved Tetrapeptide Predicted by Theoretical Simulations

著者 (4件)： JIAO Tiantian (Beijing Normal Univ., Beijing, CHN) ,  GAO Lianghui (Beijing Normal Univ., Beijing, CHN) ,  CHEN Xuebo (Beijing Normal Univ., Beijing, CHN) ,  FANG Weihai (Beijing Normal Univ., Beijing, CHN)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 116  号： 49  ページ： 14318-14323  発行年： 2012年12月13日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 組合せ半経験的量子力学と分子力学分子動力学シミュレーション及び高理論水準のCASPT2/CASSCF/Amber計算を用いることによってジスルフィド架橋を有する光開裂環状テトラペプチドの折畳み動力学を理論的に調べた。アセトニトリル中紫外線照射した環状テトラペプチドはBoc-Cys-Pro-Aib-Cys-OMeである。アセトニトリル溶媒中硫黄ビラジカルの再結合のほかに,ペプチドは二重硫黄複素環構造または完全開放構造に再折畳むことができた。硫黄ラジカル二環状化反応と分子内水素移動はシステニルラジカルの低再結合速度にそれぞれ係わっている。一方,メタノール溶媒中硫黄ラジカル周りの溶媒ケージ形成はラジカルの密接接触の可能性を縮減した。ペプチドの立体配座変化に対応するアミドIモードの計算赤外スペクトルは実験観測を良く説明できた。

シソーラス用語： *オリゴペプチド ,  シクロペプチド ,  *ジスルフィド結合 ,  分子構造 ,  立体配座 ,  紫外線照射 ,  *折畳み構造 ,  ビラジカル ,  再結合 ,  硫黄複素環化合物 ,  環化反応 ,  水素移動 ,  速度依存性 ,  C-N結合 ,  赤外スペクトル ,  配座転移 ,  半経験的方法 ,  量子論 ,  分子内力学 ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  CASSCF法 ,  プログラムパッケージ ,  フラグメンテーション ,  *光分解 ,  溶媒効果 ,  時間発展 ,  状態密度 ,  動径分布関数 ,  スペクトル線帰属 ,  脂肪族ニトリル ,  脂肪族アルコール
準シソーラス用語： AMBER ,  CASPT2 ,  アミド結合 ,  ジスルフィド架橋 ,  テトラペプチド ,  環状化 ,  環状ペプチド ,  光開裂 ,  再結合速度 ,  時間進化 ,  分子動力学シミュレーション ,  分子力学 ,  立体配座変化 ,  量子力学 ,  量子力学/分子力学法 ,  ペプチド立体配座

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  有機化合物の赤外スペクトル及びRaman散乱,Ramanスペクトル  (BM08064T)

物質索引 (3件)： アセトニトリル ,  メタノール ,  Boc-L-Cys(1)-L-Pro-Aib-L-Cys(1)-OMe

タイトルに関連する用語 (8件)： 理論 ,  シミュレーション ,  予測 ,  光開裂 ,  テトラペプチド ,  折畳み ,  動力学 ,  赤外スペクトル