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J-GLOBAL ID：201302293759823828   整理番号：13A0803356

比較ゲノミクスに対する非冗長性ゲノム選択のための系統発生ゲノムクラスタ化

Phylogenomic clustering for selecting non-redundant genomes for comparative genomics

著者 (4件)： MORENO-HAGELSIEB Gabriel (Wilfrid Laurier Univ., ON, CAN) ,  WANG Zilin (Wilfrid Laurier Univ., ON, CAN) ,  WALSH Stephanie (Wilfrid Laurier Univ., ON, CAN) ,  ELSHERBINY Aisha (Wilfrid Laurier Univ., ON, CAN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 7  ページ： 947-949  発行年： 2013年04月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 比較ゲノミクスは,しばしば非冗長性ゲノムデータセットを必要とする。異なる種の名前を持ついくつかの菌株は種の名前を共有する多くの菌株と類似している可能性があるが,種の名前を共有するいくつかの菌株は異なるグループとされるほど異なっていることがあり,いくつかのゲノムは種の名前を欠いている。系統発生ゲノム距離測定に基づいて異なる閾値において冗長性ゲノムのグループにゲノムデータセットをクラスタ化する方法およびWebサーバを実現した。

シソーラス用語： *遺伝学 ,  *ゲノム ,  *冗長性 ,  *系統発生 ,  クラスタ化 ,  集合 ,  微生物 ,  計算機システム ,  Web【情報システム】
準シソーラス用語： Webサーバ ,  データセット ,  菌株 ,  *比較ゲノミクス

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 比較ゲノミクス ,  冗長性 ,  ゲノム選択 ,  系統発生 ,  ゲノム ,  クラスタ化