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J-GLOBAL ID：201302294633104512   整理番号：13A0803341

454のパイロシーケンシングデータからの重複読取のフィルタリング

Filtering duplicate reads from 454 pyrosequencing data

著者 (6件)： BALZER Susanne (Norwegian Marine Data Centre, Bergen, NOR) ,  BALZER Susanne (Univ. Bergen, Bergen, NOR) ,  MALDE Ketil (Norwegian Marine Data Centre, Bergen, NOR) ,  GROHME Markus A. (Univ. Applied Sci. Wildau, Wildau, DEU) ,  JONASSEN Inge (Univ. Bergen, Bergen, NOR) ,  JONASSEN Inge (Uni Computing, Bergen, NOR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 7  ページ： 830-836  発行年： 2013年04月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： シーケンシングノイズおよび重複を除くためのいくつかのツールがあるにもかかわらず,重複除去は追加情報を含む流動値におけるよりむしろヌクレオチド配列に基づいている。新規ツール,JATACを用いて,直接流動値を解析することにより除かれる正確な重複に向けた手法を示した。流動データ特性における以前の知見を用いて,Bayes距離尺度と読取クラスタ化を組み合わせた。最後に,既存アルゴリズムを用いたベンチマークを与えた。

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,  *ヌクレオチド配列 ,  Bayes推定 ,  クラスタ ,  アルゴリズム ,  ベンチマーク
準シソーラス用語： *ピロシークエンシング

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (3件)： パイロシーケンシング ,  読取 ,  フィルタリング