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J-GLOBAL ID：201302297002877012   整理番号：13A1201701

エミリアニア属(Emiliania)の植物プランクトンの世界的分布を支えるパンゲノム

Pan genome of the phytoplankton Emiliania underpins its global distribution

著者 (40件)： READ Betsy A. (California State Univ. San Marcos, California, USA) ,  SARNO Analissa F. (California State Univ. San Marcos, California, USA) ,  KEGEL Jessica (Alfred Wegener Inst. Helmholtz Center for Polar and Marine Res. (AWI), Bremerhaven, DEU) ,  FRICKENHAUS Stephan (Alfred Wegener Inst. Helmholtz Center for Polar and Marine Res. (AWI), Bremerhaven, DEU) ,  VALENTIN Klaus (Alfred Wegener Inst. Helmholtz Center for Polar and Marine Res. (AWI), Bremerhaven, DEU) ,  JOHN Uwe (Alfred Wegener Inst. Helmholtz Center for Polar and Marine Res. (AWI), Bremerhaven, DEU) ,  KLUTE Mary J. (Univ. Alberta, Alberta, CAN) ,  AGUILAR Maria (Univ. Alberta, Alberta, CAN) ,  HERMAN Emily K. (Univ. Alberta, Alberta, CAN) ,  DACKS Joel B. (Univ. Alberta, Alberta, CAN) ,  KUO Alan (US Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  SALAMOV Asaf (US Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  SHMUTZ Jeremy (US Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  GRIGORIEV Igor V. (US Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  LEFEBVRE Stephane C. (J. Craig Venter Inst., California, USA) ,  MAUMUS Florian (Inst. National de la Rech. Agronomique, Versailles, FRA) ,  MAYER Christoph (Forschungsmuseum Alexander Koenig, Bonn, DEU) ,  MAYER Christoph (Ruhr-Univ., Bochum, DEU) ,  MILLER John (Univ. Maryland, Maryland, USA) ,  DELWICHE Charles F. (Univ. Maryland, Maryland, USA) ,  MONIER Adam (Monterey Bay Aquarium Res. Inst., California, USA) ,  WORDEN Alexandra Z. (Monterey Bay Aquarium Res. Inst., California, USA) ,  YOUNG Jeremy (Univ. Coll. London, London, GBR) ,  CLAVERIE Jean-Michel (Aix-Marseille Univ., Marseille, FRA) ,  OGATA Hiroyuki (Aix-Marseille Univ., Marseille, FRA) ,  FRICKENHAUS Stephan (Hochsch. Bremerhaven, Bremerhaven, DEU) ,  GONZALEZ Karina (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  LIN Yao-Cheng (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  VAN DE PEER Yves (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  NAPIER Johnathan (Rothamsted Res., Harpenden, GBR) ,  SHMUTZ Jeremy (HudsonAlpha Genome Sequencing Center, Alabama, USA) ,  SCHROEDER Declan (Marine Biological Assoc. of the UK, Plymouth, GBR) ,  WHEELER Glen (Marine Biological Assoc. of the UK, Plymouth, GBR) ,  DE VARGAS Colomban (Univ. Pierre et Marie Curie, Roscoff, FRA) ,  VERRET Frederic (Univ. Essex, Colchester, GBR) ,  VON DASSOW Peter ,  DYHRMAN Sonya T. ,  GLOECKNER Gernot ,  RICHARDS Thomas ,  ZHANG Xiaoyu (California State Univ. San Marcos, California, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 499  号： 7457  ページ： 209-213  発行年： 2013年07月11日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 円石藻は,2億年以上にわたって地球の気候に影響を与え続けてきた海洋植物プランクトンで,一部の生態系では全炭素固定量の20%が円石藻によるものである。円石藻のブルーム(大増殖)は数十万平方キロメートルにも達することがあり,また円石藻は炭酸カルシウムでできた精緻な外骨格(円石)が特徴的である。これらの特性のために,こうしたブルームは宇宙からも見ることができる。円石藻は炭素を有機物と方解石の形で海底へと輸送するが,石灰化の過程ではCO₂を放出する。従って,炭素循環には複雑な影響を及ぼし,CO₂生産を促進するか,あるいはCO₂を取り込んで隔離し,深海へと輸送するかのどちらかである。本論文では,円石藻エミリアニア・ハクスレイ(Emiliania huxleyi)のCCMP1516株から得た,ハプト植物門として初めての参照ゲノム配列と,それ以外の13の単離株から得た塩基配列を報告する。解析の結果,パンゲノム(株間で共通するコア遺伝子群と株間での違いが大きい遺伝子群とを合わせたもの)の存在が明らかになり,これはおそらく反復配列の不規則な補充によって支えられていることが判明した。株間の比較により,これまで長い間単一の種と考えられてきたエミリアニア・ハクスレイには,ゲノムレベルで高い多様性があり,これがさまざまな代謝レパートリーに反映されていることが明らかになった。この種複合体におけるゲノムの多様性が,赤道から亜北極地域にまたがる幅広い海域で生息できる能力と,さまざまな環境条件のもとで大規模な一時的ブルームを引き起こす能力を支えているらしい。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： *植物プランクトン ,  植物性鞭毛虫類 ,  藻類 ,  *ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  系統差 ,  生物多様性 ,  代謝 ,  炭素循環 ,  二酸化炭素
準シソーラス用語： *Emiliania huxleyi ,  *パンゲノム ,  遺伝的多様性 ,  円石藻

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (7件)： エミリアニア属 ,  Emiliania ,  植物プランクトン ,  世界 ,  分布 ,  パン ,  ゲノム