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J-GLOBAL ID：201302299290923824   整理番号：13A1201702

がんにおける突然変異の不均一性と新たながん関連遺伝子の探索

Mutational heterogeneity in cancer and the search for new cancer-associated genes

著者 (40件)： LAWRENCE Michael S. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  STOJANOV Petar (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  POLAK Paz (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  KRYUKOV Gregory V. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  CIBULSKIS Kristian (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  SIVACHENKO Andrey (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  CARTER Scott L. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  STEWART Chip (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  MERMEL Craig H. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  KIEZUN Adam (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HAMMERMAN Peter S. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  MCKENNA Aaron (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  DRIER Yotam (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  ZOU Lihua (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  RAMOS Alex H. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  PUGH Trevor J. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  STRANSKY Nicolas (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HELMAN Elena (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  KIM Jaegil (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  SOUGNEZ Carrie (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  AMBROGIO Lauren (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  NICKERSON Elizabeth (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  SHEFLER Erica (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  CORTES Maria L. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  AUCLAIR Daniel (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  SAKSENA Gordon (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  VOET Douglas (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  NOBLE Michael (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  DICARA Daniel (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LIN Pei (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LICHTENSTEIN Lee (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HEIMAN David I. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  FENNELL Timothy (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  IMIELINSKI Marcin (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HERNANDEZ Bryan (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HODIS Eran (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  BACA Sylvan (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  DULAK Austin M. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LOHR Jens (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LANDAU Dan-Avi (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 499  号： 7457  ページ： 214-218  発行年： 2013年07月11日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： がんのイニシエーションと進行に関わる全遺伝子の包括的カタログを作る目的で,大規模な国際プロジェクトが進行中である。これらの研究では,対応する腫瘍と正常組織の検体について塩基配列解読を行った後,数理的解析により,偶然に生じると予測されるよりも高い頻度で変異が起きている遺伝子を突き止める。本研究では,がんゲノム研究の根本的な問題,すなわち,扱うサンプルサイズの増大に伴い,現在の解析方法では有意と推定される遺伝子が次々と生み出され,リストに含まれる遺伝子の数が数百に膨れ上がってしまう問題について述べる。このリストには,嗅覚受容体や筋タンパク質タイチンなど,該当するとは思えない遺伝子が多く含まれ,多数の偽陽性の結果が,ドライバー変異を隠してしまっていることが示唆される。我々は,この問題の大部分が突然変異の不均一性に起因するものであることを示し,この問題を解決する新しい解析法,MutSigCVについて報告する。MutSigCVを,腫瘍と正常検体の3,083ペアから得たエキソーム塩基配列に適用したところ,がんタイプ内での変異の頻度および変異スペクトルに非常に著しい変動があること(これによって変異プロセスや病因が明らかにされる),また,ゲノム全体での変異頻度にも著しい変動があること(これはDNA修復のタイミング,さらに転写活性とも強い関連がある)が分かった。突然変異の不均一性を解析に組み込むことで,MutSigCVは,明白な人為的結果のほとんどを除外することができ,真にがんと関連した遺伝子を同定することが可能になる。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： 不均一性 ,  *突然変異 ,  *遺伝子 ,  *腫瘍過程 ,  *腫瘍進行度 ,  *発癌 ,  癌遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  *遺伝学 ,  ゲノム ,  DNA修復 ,  転写【遺伝】 ,  *同定 ,  腫瘍 ,  検出
準シソーラス用語： *腫瘍関連遺伝子 ,  *腫瘍進行 ,  ゲノム研究 ,  *ゲノム解析 ,  エクソーム ,  転写活性 ,  *遺伝子同定 ,  偽陽性

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (5件)： がん ,  突然変異 ,  不均一性 ,  遺伝子 ,  探索