上田卓見

ウエダタクミ | Takumi Ueda

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： http://kaken.nii.ac.jp/d/r/20451859.ja.html

研究分野 (1件)：薬系分析、物理化学

研究キーワード (28件)： NMR , 膜タンパク質 , 転移交差飽和法 , タンパク質-タンパク質相互作用 , 構造生物学 , 光合成明反応 , photosynthesis , CCR1 , オピオイド受容体 , 生化学 , アドレナリン受容体 , 交差飽和法 , 電子移動反応 , フェレドキシン , Membrane protein , ケモカイン受容体 , protein-protein interaction , electron transfer , 過渡的相互作用 , マルチドメイン蛋白質 , 膜蛋白質 , GPCR , Segmental labeling , 核磁気共鳴法 , transferred cross saturation , 循環的電子伝達 , 光化学系I , Protein Trans-Splicing

競争的資金等の研究課題 (18件)：

2024 - 2028 タンパク質主鎖環化反応の開発と高精度溶液構造解析への応用
2023 - 2026 GPCRの活性化状態が薬物の親和性を規定するメカニズムの解明
2023 - 2025 溶液NMR法による効率的な特殊ペプチドの動的立体構造解析法の開発
2021 - 2023 薬物とGPCRの弱い相互作用が滞在時間に応じて生体応答を制御する機構の解明
2020 - 2023 核磁気共鳴法によるG蛋白質共役型受容体の活性制御機構の解明

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論文 (55件)：

Soichiro Ohta, Shigeru Shimamoto, Haruka Oda, Tadayasu Ohkubo, Hiroya Oki, Yutaro Shiraishi, Kazuki Kawahara, Takuya Yoshida, Takumi Ueda. Integrative Real-Time NMR and X-ray Crystallography Reveal Prostaglandin D ₂ Metabolism. Analytical Chemistry. 2025
Takumi Ueda, Tomoki Tsuchida, Masatoshi Kurita, Takuya Mizumura, Shunsuke Imai, Yutaro Shiraishi, Yutaka Kofuku, Shuhei Miyakawa, Kaori Fukuzawa, Koh Takeuchi, et al. Structural basis of the residence time of adenosine A2A receptor ligands revealed by NMR. Chemical science. 2025
Yota Sukigara, Hajime Kamoshida, Yuji Tokunaga, Miwa Fujisaki, Misaki Imai, Yoko Kobayashi, Yutaka Kofuku, Takumi Ueda, Ichio Shimada, Koh Takeuchi. Cell Permeability and Target Engagement of Middle-Sized Molecules Quantified by In-Cell NMR. Analytical chemistry. 2025
Mayu Okada, Yutaka Tateishi, Eri Nojiri, Tsutomu Mikawa, Sundaresan Rajesh, Hiroki Ogasa, Takumi Ueda, Hiromasa Yagi, Toshiyuki Kohno, Takanori Kigawa, et al. Multistate Structure Determination and Dynamics Analysis Reveals a Unique Ubiquitin-Recognition Mechanism in Ubiquitin C-terminal Hydrolase. Journal of the American Chemical Society. 2025. 147. 33. 29884-29894
Koh Takeuchi, Takumi Ueda, Misaki Imai, Miwa Fujisaki, Masanari Tsujimura, Yuji Tokunaga, Yutaka Kofuku, Ichio Shimada. Two-step target recognition for the competitive inhibition activity of an anti-VEGF aptamer. RNA (New York, N.Y.). 2025

MISC (103件)：

上田卓見, 幸福裕, 竹内恒, 今井駿輔, 白石勇太郎, 嶋田一夫. 溶液NMR法によるGPCRの活性と直結する動的構造平衡の解明-Function-Related Conformational Dynamics of GPCRs Revealed by Solution NMR-ミニ特集生理学的環境での生体高分子の挙動の観察可能性の追求. 日本結晶学会誌 = Journal of the Crystallographic Society of Japan. 2022. 64. 4. 279-284
幸福裕, 今井駿輔, 上田卓見, 嶋田一夫. GPCRのNMR・ESR解析-Dynamics of GPCR revealed by NMR/ESR-特集 Gタンパク質共役型受容体(GPCR)の新展開. 細胞. 2021. 53. 5. 280-284
白石勇太郎, 夏目芽依, 幸福裕, 今井駿輔, 中田國夫, 水越利巳, 上田卓見, 岩井秀夫, 嶋田一夫. 健康・医療・創薬に貢献する物理系薬学研究の最前線 Gタンパク質共役型受容体のシグナル伝達制御機構の解明. 日本薬学会年会要旨集. 2019. 139年会. 1. 136-136
上田卓見, 幸福裕, 嶋田一夫. NMR法による脂質がGPCRの活性を制御する機構の解明. Annual report = 低温科学研究センター年報 / 低温科学研究センター編集委員会編. 2019. 11. 17-22
上田卓見, 嶋田一夫. NMR 解析の最前線:分子間相互作用と動的構造. 月刊細胞. 2019. 51. 596-599

学位 (1件)：

薬学博士 (東京大学大学院薬学系研究科)

経歴 (2件)：

2019/05 - 2024/03 東京大学大学院薬学系研究科生命物理化学教室准教授
2007/01 - 2019/04 東京大学薬学研究科(研究院) 助教

所属学会 (4件)：

日本薬学会 , 日本生物物理学会 , 日本核磁気共鳴学会 , 日本蛋白質科学会

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