研究者
J-GLOBAL ID:201401014621439668   更新日: 2024年11月05日

小笠原 理

Ogasawara Osamu
所属機関・部署:
職名: 特任准教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
  • 情報・システム研究機構  国立情報学研究所   特任准教授
研究分野 (1件): 生命、健康、医療情報学
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2019 - 2021 国際的データシェアリングに関する課題解決のための調査研究及び開発研究
  • 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2015 - 2020 インタークラウドを活用したアプリケーション中心型オーバーレイクラウド技術に関する研究
  • 2009 - 2010 自然言語処理と集合知によるデータ解析手法の分類方法の開発
論文 (38件):
  • Yuichi Kodama, Takeshi Ara, Asami Fukuda, Toshiaki Tokimatsu, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2024: the DDBJ Group Cloud service for sharing pre-publication data. Nucleic acids research. 2024
  • Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata. Nucleic acids research. 2023
  • Osamu Ogasawara. Building cloud computing environments for genome analysis in Japan. Human Genome Variation. 2022
  • 藤澤 貴智, 小笠原 理, 中村 保一, 有田 正規. DDBJサービスの統合化を目指して. トーゴーの日2022. 2022. 51. D1. 1
  • Hirotaka Suetake, Tomoya Tanjo, Manabu Ishii, Bruno P. Kinoshita, Takeshi Fujino, Tsuyoshi Hachiya, Yuichi Kodama, Takatomo Fujisawa, Osamu Ogasawara, Atsushi Shimizu, et al. Sapporo: A workflow execution service that encourages the reuse of workflows in various languages in bioinformatics. F1000Research. 2022. 11. 889-889
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MISC (2件):
  • 神沼英里, 神沼英里, 藤澤貴智, 林史, 中村保一, 高木利久, 瀬々潤, 小笠原理. ディープラーニングを用いたDNA配列からの微生物生態属性値の予測. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2018. 12th
  • 神沼英里, 藤澤貴智, 林史, 西澤達也, 中村保一, 小笠原理. 機械学習によるDNA配列からのBioSample生態関連属性値の注釈予測. 日本微生物生態学会大会(Web). 2017. 2017
書籍 (2件):
  • 実験医学 2022年4月号 Vol.40 No.6 遺伝研スーパーコンピュータシステムの利用方法
    羊土社 2022
  • 実験医学 2022年4月号 Vol.40 No.6 スパコン・クラウドを生命科学に使う〜ペタバイト時代を生き抜くためのシステム整備とデータ活用事例
    羊土社 2022
Works (1件):
  • 遺伝研スーパーコンピュータシステム
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