中村真也

ナカムラシンヤ | Nakamura Shinya

所属機関・部署：
職名：講師
ホームページURL (1件)： http://kaken.nii.ac.jp/d/r/10510109.ja.html

研究分野 (1件)：薬系分析、物理化学

研究キーワード (7件)：物理化学 , フラグメント分子軌道法 , 計算化学 , SBDD , 分子設計 , 分子動力学 , 構造活性相関

競争的資金等の研究課題 (1件)：

論文 (41件)：

Keiji Nishiwaki, Shiori Nakatani, Shinya Nakamura, Kenji Yoshioka, Eri Nakagawa, Masato Tsuyuguchi, Takayoshi Kinoshita, Isao Nakanishi. Enhanced inhibitory activity of compounds containing purine scaffolds compared to protein kinase CK2α considering crystalline water. RSC Medicinal Chemistry. 2024
Katsuki Takashima, Shinya Nakamura, Maiko Nagayama, Shinsuke Marumoto, Fumihiro Ishikawa, Weijia Xie, Isao Nakanishi, Osamu Muraoka, Toshio Morikawa, Genzoh Tanabe. Role of the thiosugar ring in the inhibitory activity of salacinol, a potent natural α-glucosidase inhibitor. RSC Advances. 2024. 14. 7. 4471-4481
Keiji Nishiwaki, Shinya Nakamura, Kenji Yoshioka, Eri Nakagawa, Shiori Nakatani, Masato Tsuyuguchi, Takayoshi Kinoshita, Isao Nakanishi. Design, Synthesis and Structure-Activity Relationship Studies of Protein Kinase CK2 Inhibitors Containing a Purine Scaffold. Chemical and Pharmaceutical Bulletin. 2023. 71. 7. 558-565
Tatsuo Akaki, Shinya Nakamura, Keiji Nishiwaki, Isao Nakanishi. Fragment Molecular Orbital based affinity prediction toward pyruvate dehydrogenase kinases: Insights into the charge transfer in hydrogen bond networks. Chemical and Pharmaceutical Bulletin. 2023. 71. 4. 299-306
Shinya Nakamura, Tatsuo Akaki, Keiji Nishiwaki, Midori Nakatani, Yuji Kawase, Yuki Takahashi, Isao Nakanishi. System truncation accelerates binding affinity calculations with the fragment molecular orbital method: A benchmark study. Journal of Computational Chemistry. 2022. 44. 7. 824-831

MISC (28件)：

奥村政輝, 中西伸介, 栗本泰奈, 西脇敬二, 中村真也, 大石真也, 大野浩章, 仲西功. Pyrazole骨格を有するCK2阻害剤の窒素スキャンによる構造活性・物性相関研究. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2020. 140th
奥村政輝, 中西伸介, 栗本泰奈, 西脇敬二, 中村真也, 大石真也, 大野浩章, 仲西功. Pyrazole骨格を有するCK2阻害剤の構造活性相関研究~窒素置換による物性・活性改善の検討~. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2019. 47th (CD-ROM)
脇谷航平, 関口富美子, 坪田真帆, 中村真也, 仲西功, 川畑篤史. RAGEを標的とした化学療法誘起末梢神経障害治療薬の探索 in silicoドラッグ・リプロファイリング/リポジショニングからのアプローチ. PAIN RESEARCH. 2018. 33. 2. 157-157
脇谷航平, 関口富美子, 坪田真帆, 中村真也, 仲西功, 川畑篤史. AzelastineはRAGEが関与する化学療法誘起末梢神経障害の発症を抑制する-ドラッグ・リプロファイリング/リポジショニング研究からの知見. 日本薬理学会近畿部会プログラム・要旨集. 2018. 133rd. 44
中川愛理, 吉岡賢司, 露口正人, 木下誉富, 中村真也, 西脇敬二, 仲西功. プリン骨格を有する新規CK2阻害剤の構造活性相関研究. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2018. 138th. ROMBUNNO.27PA-pm097

書籍 (2件)：

講演・口頭発表等 (19件)：

Improvement of Pseudo-molecule Generation on Solvent Dipole Ordering Virtual Screening (SDO-VS)
(第11回薬物の分子設計と開発に関する日中合同シンポジウム 2018)
計算化学初心者のための分子動力学計算講習会 ~WindowsPCで行うMD計算の環境作りと失敗しないための考え方~
(第8回ケモインフォマティクス入門講座 2017)
Solvent Dipole Ordering の創薬への応用研究
(第10回分子科学討論会2016神戸 2016)
計算化学初心者のための分子動力学計算講習会 ~計算環境の構築と失敗しないための考え方~
(第3回ケモインフォマティクス入門講座 2016)
サラシア属植物由来化合物を起源とする計算化学による高活性化合物探索研究
(第6回サラシア属植物シンポジウム 2013)

学位 (1件)：

経歴 (4件)：

受賞 (3件)：

2017/11 - サラシア属植物普及協会サラシア属植物普及協会会長賞サラシア属植物由来化合物を起源とする計算化学による高活性化合物探索研究
2016/09 - 日本化学会情報化学部会 Journal of Computer Aided Chemistry論文賞 A Mini-review on Chemoinformatics Approaches for Drug Discovery
2005/09 - 日本薬学会構造活性相関部会 SAR Promotion Award

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中村 真也