- 2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 2021 - 2026 嘔吐するモデル動物スンクスを用いた手術後悪心嘔吐の脳内機序の解明
- 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 2013 - 2016 「個」のゲノム科学を実現するための統合的技術基盤の開発研究
- 2010 - 2016 ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
- 2012 - 2015 ヘテロ接合性を考慮した次世代シークエンサ用ゲノムアセンブラ/遺伝子予測手法の開発
- 2010 - 2011 真菌を含む微生物メタゲノムからの遺伝子予測および種分類
- 2005 - 2009 大規模ゲノム情報の比較技術と知識発見
- 2003 - 2005 網羅的DNA-蛋白相互作用データに基づく染色体のモデル表現
- 2004 - 2004 比較ゲノム解析および遺伝子発現プロファイルに基づいたプロモータ情報構造の解析
- 1999 - 2003 真核生物染色体のS期に於ける動態の全て-出芽酵母第六染色体をモデルとして
- 2002 - 2002 比較ゲノム解析をベースとした機能領域探索法の開発
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