- 2013 - 2014 DNAループによる転写調節機構の解明
- 2009 - 2013 ゲノムワイドな遺伝子ネットワーク解析による脊索動物の発生と進化のシステム的理解
- 2008 - 2009 ホヤ胚発生を支配する転写制御ネットワーク
- 2008 - 2009 ホヤ胚発生の包括的理解のための遺伝子発現アトラスの作製にむけた試み
- 2005 - 2007 ホヤ初期胚発生におけるゲノムワイドな転写因子ネットワークの解析
- 2005 - 2005 ホヤゲノムにおける5'スプライスリーダー配列をもつmRNAの網羅的解析
- 2002 - 2004 ホヤ胚の内胚葉分化と中胚葉誘導における分子機構の解明
- 2000 - 2001 ホヤ胚の筋肉細胞分化決定機構の解析
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