米澤康滋

ヨネザワヤスシゲ | Yonezawa Yasushige

ホームページURL (1件)： http://kaken.nii.ac.jp/d/r/40248753.ja.html

研究分野 (1件)：生物物理学

研究キーワード (30件)：熱安定性 , 相図 , 構造情報解析 , 中性子結晶構造解析 , PDBデータベース , 酵母発現 , 中性子IP , 中性子結晶回析 , 水和水 , ヒトリゾチーム , 蛋白結晶化 , 蛋白溶解度 , 分子シミュレーション , 量子化学 , 生物物理 , 音声出力 , 酵素反応 , 分子動力学 , 生体分子 , 分子軌道法 , JAVA開発環境 , ユーザ・インタデース , リンク原子 , 文献データベース , 点字表示機能付エディタ , 局在化分子軌道 , 画面情報 , QCD , 反応自由エネルギー , 視覚障害補償機器

競争的資金等の研究課題 (20件)：

2022 - 2025 イノシトールリン脂質認識機構に立脚したイオンチャネルー脂質連関の理解
2022 - 2025 新規アロステリック薬発見を目指したガン糖代謝関連タンパク質の動的分子構造解析
2021 - 2024 電気信号を化学信号に変える電位依存性ホスファターゼVSPの動作機構の解明
2017 - 2022 平均力ダイナミクスの拡張による生体分子のレア・イベント予測
2014 - 2019 分子シミュレーションによる生体活性サイトの構造・機能相関の解明とデザイン

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論文 (125件)：

Yuko Tsuchiya, Kei Taneishi, Yasushige Yonezawa. Autoencoder-based detection of the residues involved in G protein-coupled receptor signaling. Scientific Reports. 2021. 11. 1
Naoyuki Miyashita, Yasushige Yonezawa. Mutual information analysis of the dynamic correlation between side chains in proteins. The Journal of Chemical Physics. 2021. 155. 4. 044107-044107
Kei Moritsugu, Norifumi Yamamoto, Yasushige Yonezawa, Shin-ichi Tate, Hiroshi Fujisaki. Path Ensembles for Pin1-Catalyzed Cis-Trans Isomerization of a Substrate Calculated by Weighted Ensemble Simulations. Journal of Chemical Theory and Computation. 2021. 17. 4. 2522-2529
Tomoki Himiyama, Yuko Tsuchiya, Yasushige Yonezawa, Tsutomu Nakamura. Rebuilding Ring-Type Assembly of Peroxiredoxin by Chemical Modification. Bioconjugate Chemistry. 2021. 32. 1. 153-160
Hiromitsu Shimoyama, Yasushige Yonezawa. Atomistic detailed free-energy landscape of intrinsically disordered protein studied by multi-scale divide-and-conquer molecular dynamics simulation. Journal of Computational Chemistry. 2021. 42. 1. 19-26

MISC (18件)：

清岡和俊, 櫻井一正, 米澤康滋, 白木琢磨. 化合物数と多様性をめぐる医薬品ライブラリーの温故知新. 近畿大学先端技術総合研究所紀要. 2023. 28
白木琢磨, 櫻井一正, 米澤康滋. -研究ノート-アロステリック制御薬剤探索に向けた高圧力蛋白質研究センターの取り組み. 近畿大学先端技術総合研究所紀要. 2022. 27
松倉里紗, 大西庸嵩, 古江祐也, 宮下尚之, 白木琢磨, 米澤康滋. DFHBIの有無によるリボスイッチSPINACH中のイオンの動力学への影響. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2019. 74. 2
Naoyuki Miyashita, Nobutaka Onishi, Masaya Furue, Takuma Shiraki, Yasushige Yonezawa. Dynamics of the gate of DFHBI and ions in riboswitch SPINACH. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 2018. 256
Hiroshi Fujisaki, Yasushige Yonezawa, Motoyuki Shiga, Luca Maragliano, Shin-ichi Tate. Exploring Reaction Pathways for Peptidylprolyl-Isomerase. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 449A-449A

講演・口頭発表等 (28件)：

計算科学シミュレーションを用いたタンパク質及びタンパク質複合体の動的相関解析の困難と新たな試み
(第21回日本蛋白質科学会年会ワークショップ 2021)
Pin1由来のタンパク質分解酵素の触媒部位の構造ダイナミクス
(第18回日本蛋白質科学会年会 2018)
ベイズ推定によるOn-the-fly MDシミュレーション平均構造決定及び動的解析方法
(第18回日本蛋白質科学会年会 2018)
電位依存性プロトンチャネルの機能・構造解析
(CREST「構造生命」領域会議 2017)
ベイズ推定によるon-the-fly MDトラジェクトリ解析方法の開発
(第31回分子シミュレーション討論会 2017)

学位 (1件)：

工学博士 (筑波大学大学院)

経歴 (3件)：

2011/04 - 現在近畿大学教授
2002/12 - 2011/03 大阪大学蛋白質研究所特任准教授
1992/04 - 2002/12 筑波技術短期大学情報処理学科講師

受賞 (1件)：

2014/10 - 日本学術振興会科研費審査委員表彰

所属学会 (6件)：

理論化学研究会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 分子科学会 , 日本生物物理学会 , 日本蛋白質科学会 , 分子シミュレーション研究会

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