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J-GLOBAL ID：201402203737150500   整理番号：14A0032519

DNA二本鎖末端近傍での単一塩基フリップと鎖滑り間の関係を解析する

Analyzing the Relationship between Single Base Flipping and Strand Slippage near DNA Duplex Termini

著者 (2件)： BANAVALI Nilesh K. (New York State Dep. of Health, New York, USA) ,  BANAVALI Nilesh K. (State Univ. New York at Albany, New York, USA)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 117  号： 46  ページ： 14320-14328  発行年： 2013年11月21日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ここでは部分的単一塩基フリップがDNA二本鎖末端近傍で鎖滑りに対し十分なことを示した最新研究を詳しく調べた。塩基フリップと鎖滑りの幾何学的パラメータに沿い明示二次元自由エネルギープロフィルを得るため,単一塩基欠失突然変異ホットスポットDNA配列における拘束グアニンとシトシン塩基フリップを解析した。集団変数鎖滑り幾何学的パラメータをその成分距離に分解して単一塩基フリップへの応答における滑りの詳細機構を明らかにした。このホットスポットDNA配列における部分的フリップしたシトシンに対する準安定状態を生じるトランスWatson-Crick:糖端部相互作用のエネルギー学的安定化も特性化した。将来研究の可能性と一緒に核酸鎖伸長におけるインデル突然変異の配列依存性に対するこれらの結果の関係を考察した。

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  *欠失突然変異 ,  プライマー【遺伝】 ,  鋳型【遺伝】 ,  *ヌクレオチド配列 ,  溝 ,  幾何学量 ,  ホットスポット ,  準安定状態 ,  *ピリミジン塩基 ,  *プリン塩基 ,  二面角 ,  自由エネルギー ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  突然変異 ,  安定化 ,  相関係数 ,  反応機構 ,  二重螺旋 ,  窒素複素環化合物 ,  ヒドロキシ化合物 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： DNA配列 ,  Watson-Crick ,  塩基対合 ,  幾何学的パラメータ ,  主溝【DNA】 ,  副溝【DNA】 ,  分子動力学シミュレーション ,  二本鎖DNA

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (2件)： グアニン ,  シトシン

タイトルに関連する用語 (5件)： DNA ,  近傍 ,  塩基 ,  滑り ,  解析