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J-GLOBAL ID：201402203805093285   整理番号：13A1486955

F-スコアと部分最小二乗-判別分析を使用するプロテオーム質量分光データからの特徴選択

Feature selection from proteomic mass spectrometric data using F-score and partial least square-discriminant analysis

著者 (3件)： ZHANG Ming-jin (青海師範大学化学系, 青海, 西寧) ,  杜一平 (華東理工大学 上海市功能性材料化学重点実験室, 上海) ,  ZHANG Shi-zhi (青海民族大学化学与生命科学学院, 青海, 西寧)
資料名： Jisuanji yu Yingyong Huaxue  (Jisuanji yu Yingyong Huaxue)
巻： 29  号： 12  ページ： 1467-1470  発行年： 2012年 
JST資料番号： C2534A  ISSN： 1001-4160  CODEN： JYYHE6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： F-スコアと部分最小二乗-判別分析(PLS-DA)に基づく特徴選択とサンプル分類方式を提示しプロテオーム質量分光(MS)データ分析とポテンシャルバイオマーカーの発見に使用した。この方式には主な段階が3つある。(1)LIMPICアルゴリズムによるスペクトル前処理。(2)変数ごとにFスコア値を計算し降順にFスコア値に従って選ぶ。(3)前方の階段状選択方式のPLS-DA交差検証法で最適特徴セットを決定。結腸直腸癌のデータセットを提示方式で分析した。結果として,8m/zの位置をポテンシャルバイオマーカーとして選んだ。これらの特徴は独立試験セットの健康規制から病気の見本を感度95.24%特異度100%で識別することができた。これらの結果はこの研究で提示した方式はプロテオームMSデータから分類特徴の選択に利用可能であることを証明した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： 部分最小二乗法 ,  判別分析 ,  プロテオーム ,  *質量 ,  *スペクトロスコピー ,  データ ,  特徴選択 ,  バイオマーカー ,  ポテンシャル ,  アルゴリズム ,  集合 ,  結腸腫瘍 ,  直腸腫瘍
準シソーラス用語： *分光 ,  データセット ,  結腸直腸癌

分類 (1件)： 質量分析  (CC03013N)

タイトルに関連する用語 (7件)： スコア ,  部分最小二乗 ,  判別分析 ,  プロテオーム ,  質量 ,  分光 ,  特徴選択