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J-GLOBAL ID：201402204075561462   整理番号：14A0680262

DebianのPredictProtein蛋白質構造および機能のクラウド予測

Cloud Prediction of Protein Structure and Function with PredictProtein for Debian

著者 (19件)： KAJAN Laszlo (TUM,Garching, DEU) ,  YACHDAV Guy (TUM,Garching, DEU) ,  YACHDAV Guy (Columbia Univ., NY, USA) ,  YACHDAV Guy (Biosof LLC, NY, USA) ,  VICEDO Esmeralda (TUM,Garching, DEU) ,  STEINEGGER Martin (TUM,Garching, DEU) ,  MIRDITA Milot (TUM,Garching, DEU) ,  ANGERMUELLER Christof (TUM,Garching, DEU) ,  BOEHM Ariane (TUM,Garching, DEU) ,  DOMKE Simon (TUM,Garching, DEU) ,  ERTL Julia (TUM,Garching, DEU) ,  MERTES Christian (TUM,Garching, DEU) ,  REISINGER Eva (TUM,Garching, DEU) ,  STANIEWSKI Cedric (TUM,Garching, DEU) ,  ROST Burkhard (TUM,Garching, DEU) ,  ROST Burkhard (Columbia Univ., NY, USA) ,  ROST Burkhard (Biosof LLC, NY, USA) ,  ROST Burkhard (WZW-Weihenstephan, Freising, DEU) ,  ROST Burkhard (Inst. for Advanced Study (TUM-IAS), Garching, DEU)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2013  号： Bioinformatics  ページ： 398968 (WEB ONLY)  発行年： 2013年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Ubuntu,Bio-LinuxおよびCloud BioLinuxのようなDebianオペレーティングシステムおよび派生物のためのPredictProteinのリリースを報告する。PredictProteinスイートは,オープンソースDebianパッケージの標準セットとして利用できる。本リリースは二次構造および溶媒接近性の予測(profphd),核局在化シグナル(predictnls),および固有障害領域(norsnet)などを含む,Rost研究室からのほとんど一般的な予測法に及ぶ。クラウドにおける高性能計算のためのPredictProteinパッケージを成功裏に利用する2つの事例研究についても提示する:1つ目は全生物に関する蛋白質障害を解析し,2つ目はヒトゲノムの蛋白質コード領域における全ての可能性のある単一配列変異の影響を解析する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： ソフトウェア ,  プログラムパッケージ ,  予測技法 ,  *オペレーティングシステム ,  *タンパク質 ,  *アミノ酸配列 ,  シグナルペプチド ,  塩基対置換
準シソーラス用語： *Debian ,  オープンソースソフトウェア ,  二次構造予測 ,  核局在化シグナル

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質構造 ,  クラウド ,  予測