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J-GLOBAL ID：201402204388430806   整理番号：14A1002582

立体配座子選択によるユビキチンイオンの光解離はプロリンペプチド結合の部位特異的シス/トランス異性化を明らかにする

Photodissociation of Conformer-Selected Ubiquitin Ions Reveals Site-Specific Cis/Trans Isomerization of Proline Peptide Bonds

著者 (5件)： WARNKE Stephan (Max-Planck-Gesellschaft, Berlin, DEU) ,  BALDAUF Carsten (Max-Planck-Gesellschaft, Berlin, DEU) ,  BOWERS Michael T. (Univ. California, California, USA) ,  PAGEL Kevin (Max-Planck-Gesellschaft, Berlin, DEU) ,  HELDEN Gert von (Max-Planck-Gesellschaft, Berlin, DEU)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 136  号： 29  ページ： 10308-10314  発行年： 2014年07月23日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 残基数76の蛋白質ヒトのユビキチンを用いて193nmにおけるUV光断片化の立体配座依存性の初めての実験的証拠を提示した。以前に,A状態と調和できる構造を持つ二つの優勢な気相立体配座を観測した11⁺電荷状態にあるユビキチンを研究した。この11⁺ユビキチンの到着時間分布データの16.7ms及び17.2msの二つの突出したピークは他より優勢なそれぞれある立体配座とそれより伸長した立体配座を示した。二つの優勢立体配座はMDシミュレーションと組み合わせてIMS(イオン易動度分光分析)-MS(質量分析)/UVPD(紫外線光解離)組合せ実験を行った。その結果はプロリンのシス/トランス異性化が高荷電状態のユビキチンの安定なA状態様の気相の立体配座を決めていることを示した。第19番目残基Proの前のペプチド結合のシス/トランス異性化がA状態でのように伸長時にこの蛋白質の全体的構造に最大の影響を及ぼすことを示した。

シソーラス用語： 立体配座 ,  *ユビキチン ,  光解離 ,  ペプチド結合 ,  異性化 ,  アミノ酸残基 ,  分子動力学 ,  質量分析 ,  スペクトロスコピー ,  紫外線照射 ,  電荷 ,  アミノ酸 ,  窒素複素環化合物 ,  イオン移動度分光分析
準シソーラス用語： IMS【分光法】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： プロリン

タイトルに関連する用語 (8件)： 立体配座 ,  ユビキチン ,  イオン ,  光解離 ,  プロリン ,  ペプチド結合 ,  トランス ,  異性化