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J-GLOBAL ID：201402206283800902   整理番号：14A0902221

保存アミノ酸残基はNpu DnaEスプリットインテインの蛋白質トランス-スプライシングを調節する

Conserved residues that modulate protein trans-splicing of Npu DnaE split intein

著者 (7件)： WU Qin (Univ. Sci. and Technol. China, Anhui, CHN) ,  GAO Zhengqiang (Inst. High Energy Physics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  WEI Yong (Inst. High Energy Physics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  MA Guolin (Univ. Sci. and Technol. China, Anhui, CHN) ,  ZHENG Yuchuan (Huangshan Univ., Anhui, CHN) ,  DONG Yuhui (Inst. High Energy Physics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  LIU Yangzhong (Univ. Sci. and Technol. China, Anhui, CHN)
資料名： Biochemical Journal  (Biochemical Journal)
巻： 461  号： 2  ページ： 247-255  発行年： 2014年07月15日 
JST資料番号： B0205A  ISSN： 0264-6021  CODEN： BIJOAK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 藍藻Nostoc punctiforme PCC73102(Npu)由来のDnaE(DNAポリメラーゼIII触媒サブユニットα)スプリットインテインがin vitroスプライシングアッセイにおいてトランススプライシングに高い触媒活性を示すのに対して藍藻Cyanobacterium synechocystis PCC6803(Ssp)由来のDnaEスプリットインテインの同スプライシングにおける触媒活性が低い理由を明らかにするために,Npu DnaEインテインのスプリット型の結晶構造を決定した。この構造から,DnaEスプリットインテインに良く保存されているN末端ドメインArg⁵⁰及びC末端ドメインSer³⁵がトランススプライシングにおいて重要であることが分かった。in vitroスプライシングアッセイにより両残基がインテイン活性の調節において協働的役割を果たしていることを実証した。結晶構造から,C末端ドメインAsn³⁶の側鎖が水素結合を通してN末端ドメインArg⁵⁰及びC末端ドメインSer³⁵と相互作用することにより蛋白質スプライシング過程でのアスパラギンの環化を容易にしていると推定した。N末端ドメインArg⁵⁰とC末端ドメインSer³⁵の一方をAla残基にて置換した変異体のインテイン活性は低下することを確証した。これらの結果から,Ssp DnaEインテインがC末端ドメインSer³⁵に相当する残基を持たないことが,同インテインの触媒活性が低いことの理由であると推定した。

シソーラス用語： アミノ酸残基 ,  *アミノ酸配列 ,  DNAポリメラーゼ ,  *RNAスプライシング ,  *触媒活性 ,  in vitro実験 ,  Synechocystis ,  *藍藻類 ,  *ネンジュモ属 ,  *結晶構造 ,  分子構造 ,  分子内水素結合 ,  水素結合 ,  末端基 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  カルボアミド ,  ジカルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： C末端ドメイン ,  DNAポリメラーゼIII ,  *Nostoc punctiforme ,  N末端 ,  Synechocystis sp. ,  アルギニン残基 ,  *インテイン ,  スプライシング【遺伝】 ,  セリン残基 ,  *トランススプライシング ,  蛋白質構造

分類 (4件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  高分子の結晶構造  (BK10000K)

物質索引 (1件)： アスパラギン

タイトルに関連する用語 (7件)： 保存 ,  アミノ酸残基 ,  NPU ,  蛋白質 ,  トランス ,  スプライシング ,  調節