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J-GLOBAL ID：201402210672092155   整理番号：14A1034327

Trimmomatic:イルミナシーケンスデータのための柔軟なトリマ

Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data

著者 (5件)： BOLGER Anthony M. (Max Planck Inst. of Molecular Plant Physiology, Golm) ,  BOLGER Anthony M. (RWTH Aachen, Aachen) ,  LOHSE Marc (Max Planck Inst. of Molecular Plant Physiology, Golm) ,  USADEL Bjoern (RWTH Aachen, Aachen) ,  USADEL Bjoern (Forschungszentrum Juelich, Juelich, DEU)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 30  号： 15  ページ： 2114-2120  発行年： 2014年08月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代シークエンシングデータを最適化できる柔軟かつ効率的前処理ツールとしてTrimmomaticを開発した。この手法は,アダプターやPCR(ポリメラーゼ連鎖反応)プライマーなどの技術配列の除去,および,品質平均が一定基準より低いリードの3’末端を除去する品質フィルタリングによりトリミングを行う。参照ベースおよび参照無タスクの両方において,Trimmomaticの前処理性能を実証した。Trimmomaticは,http://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimmomaticにてGPLライセンス下で入手可能である。

シソーラス用語： *ヌクレオチド配列 ,  *トリミング ,  データ処理 ,  アダプタ ,  プライマー【遺伝】 ,  フィルタリング ,  アルゴリズム ,  品質管理 ,  *次世代シークエンシング
準シソーラス用語： データ前処理

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)