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J-GLOBAL ID：201402214329618260   整理番号：13A1958274

多様な癌タイプでのマイクロRNA標的相互作用の分析

Analysis of microRNA-target interactions across diverse cancer types

著者 (6件)： JACOBSEN Anders (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  SILBER Joachim (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  HARINATH Girish (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  HUSE Jason T (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  SCHULTZ Nikolaus (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  SANDER Chris (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, New York, USA)
資料名： Nature Structural & Molecular Biology  (Nature Structural & Molecular Biology)
巻： 20  号： 11  ページ： 1325-1332  発行年： 2013年11月 
JST資料番号： W0637A  ISSN： 1545-9993  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 個々のmiRNAが器官や組織の起源とは無関係に腫瘍形成の共通過程を制御するという仮定を腫瘍関連ゲノムデータTCGAを用いて検討した。種々の癌タイプで活発で機能的なmiRNAと標的mRNA相互作用を推測する手法およびmiRNAとmRNA発現プロファイリングのための統計的スコア,連関反復(REC)スコアを適用し,3000種の腫瘍と11の癌タイプのmiRNAとmRNA発現プロファイルから反復性の癌関連miRNA標的関係を推測した。さらに,配列/保存性に基づく予測,文献由来の実験的に確認された標的相互作用,さらにmiRNA攪乱実験由来の発表データを利用して,これらの反復性標的関係を解析し,高信頼性の143の反復性標的関係性を持つ全癌ネットワークを導出した。多くの癌タイプの複数の経路を協調的に制御すると考えられるmiR-29ファミリーのような活発なDNA脱メチル化経路のTET1/TDGを調節する新たなmiRNAの腫瘍との関連を示唆した。

シソーラス用語： *アンチセンスRNA ,  mRNA ,  分子間相互作用 ,  分子認識 ,  データ ,  統計解析 ,  *腫瘍マーカー ,  遺伝的調節 ,  病態生理 ,  鑑別診断 ,  *腫瘤形成
準シソーラス用語： *腫瘤形成【tumorigenesis】 ,  *miRNA ,  エピジェネティック制御 ,  病型診断 ,  臨床データ

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 癌 ,  タイプ ,  マイクロRNA ,  標的 ,  相互作用 ,  分析