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J-GLOBAL ID：201402215791228920   整理番号：12A1807022

CXCR1とIL-8の間の遺伝子-遺伝子相互作用の関係と中国のホルスタインの乳腺炎感染性のリスクのMDRモデル分析

Using the MDR Model to Analyze the Relationship of Gene-Gene Interaction Between CXCR1 and IL-8 and the Risk of Mastitis Susceptibility of Chinese Holstein

著者 (7件)： Mao Yongjiang (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou) ,  Chen Renjin (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou) ,  Chen Ying (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou) ,  Chang Lingling (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou) ,  Shi Xuekui (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou) ,  Zhang Yaqin (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou) ,  Yang Zhangping (Animal Sci. and Technol. Coll.,Yangzhou Univ., Jiangsu, Yangzhou)
資料名： Zhongguo Nongye Kexue  (Zhongguo Nongye Kexue)
巻： 44  号： 9  ページ： 1908-1915  発行年： 2011年 
JST資料番号： W1459A  ISSN： 0578-1752  CODEN： CKNYAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】Multifactor Dimensionality Reduction(MDR)モデルを用い,CXCR1とIL-8の相互作用と中国のホルスタインの乳腺炎感染性のリスクにおけるそれらの影響を同定し,遺伝子-遺伝子相互作用の分析におけるその利用可能性を検証する。【メソッド】中国上海のBright Dairy集団の金山酪農場のホルスタイン634頭に対するPCR-SSCPとダイレクト塩基配列決定法によって,5番目のフランキング領域を含む7つのSNP部位の多型とCXCR1とエキソン4,IL-8のエキソン5のコーディングが検出された。そのうち228頭は乳腺炎ウシだった。そして,CXCR1とIL-8の相互作用,MDRとロジスティック回帰を用いて乳腺炎感染性のリスクにおけるそれらの影響を同定した。【結果】4つのSNPは3つのSNP(-1830(A/G),-1768(T/A),-344(T/C))を含むCXCR1のコード領域で5番目のフランキング領域と783(C/A)のコーディング領域で見つかった。2789(A/G)と2862の(T/C)部位における連結された変異は,IL-8遺伝子のために見られた。そして,この突然変異はSerからGlyへのAAの処理とArgに対するCysに帰着する。CXCR1とIL-8遺伝子の5つのSNPの多型の主作用は,1つの因子ロジスティック回帰にも基づくウシの乳腺炎感度において有意の影響を示さなかった。MDRを用いたCXCR1-(-1768)-IL-8,CXCR1-(-1768)-(783)-IL-8,CXCR1-(-1768)-(-344)-(783)-IL-8の相互作用は,ウシの乳腺炎感染性における有意な影響を示した。そして交配検証整合性が最大(10/10)であることを明らかにした。CXCR1-(-1768)-IL-8とCXCR1-(-1768)-(783)-IL-8の相互作用は,高い試験バランス精度(それぞれ0.5457と0.5485)を示した。CXCR1-(-1768)-IL-8の相互作用は,CXCR1とIL-8のマルチ遺伝子型の相互作用デンドログラムからの乳腺炎感染性...Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *CD抗原 ,  *インターロイキン受容体 ,  *ケモカイン受容体 ,  *インターロイキン8 ,  *相互作用 ,  *ホルスタイン ,  ウシ乳房炎 ,  性質 ,  リスク ,  PCR-SSCP法 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： *CXCR1 ,  *IL8 ,  *遺伝子-遺伝子相互作用 ,  遺伝子相互作用 ,  ウシ乳腺炎 ,  感染性 ,  PCR-SSCP ,  塩基配列

分類 (5件)： 獣医学一般  (FE01010J) ,  動物病一般  (FE02010Q) ,  牛  (FD02020Y) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (11件)： CXCR1 ,  遺伝子 ,  遺伝子相互作用 ,  中国 ,  ホルスタイン ,  乳腺炎 ,  感染性 ,  リスク ,  MDR ,  モデル ,  分析