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J-GLOBAL ID：201402223901783200   整理番号：14A1155745

窒素循環に関与している機能的な遺伝子を検出するために,全コミュニティゲノム増幅支援DNAマイクロアレイ方法の開発

Development of a whole community genome amplification-assisted DNA microarray method to detect functional genes involved in the nitrogen cycle

著者 (8件)： INOUE Daisuke (Kitasato Univ., Dep. of Health Sci., 1-15-1 Kitasato, 252-0373, Sagamihara-Minami, Kanagawa, JPN) ,  INOUE Daisuke (Osaka Univ., Div. of Sustainable Energy and Environmental Engineering, 2-1 Yamadaoka, 565-0871, Suita, Osaka, JPN) ,  PANG Junqin (Osaka Univ., Div. of Sustainable Energy and Environmental Engineering, 2-1 Yamadaoka, 565-0871, Suita, Osaka, JPN) ,  MATSUDA Masami (Osaka Univ., Div. of Sustainable Energy and Environmental Engineering, 2-1 Yamadaoka, 565-0871, Suita, Osaka, JPN) ,  SEI Kazunari (Kitasato Univ., Dep. of Health Sci., 1-15-1 Kitasato, 252-0373, Sagamihara-Minami, Kanagawa, JPN) ,  SEI Kazunari (Osaka Univ., Div. of Sustainable Energy and Environmental Engineering, 2-1 Yamadaoka, 565-0871, Suita, Osaka, JPN) ,  NISHIDA Kei (Univ. of Yamanashi, International Res. Centre for River Basin Environment, 4-3-11 Takeda, 400-8511, Kofu, Yamanashi, JPN) ,  IKE Michihiko (Osaka Univ., Div. of Sustainable Energy and Environmental Engineering, 2-1 Yamadaoka, 565-0871, Suita, Osaka, JPN)
資料名： World Journal of Microbiology & Biotechnology  (World Journal of Microbiology & Biotechnology)
巻： 30  号： 11  ページ： 2907-2915  発行年： 2014年11月 
JST資料番号： T0482A  ISSN： 0959-3993  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大部分の窒素循環反応に関与している重要な機能的遺伝子を標的としている新しいDNAマイクロアレイ分析が,包括的に窒素循環と関連した微生物群を分析するために開発された。開発したマイクロアレイは,nif,amo,hao/hzo,nap,nar,nirK,nirS,nrf,cnor,qnorおよびnos遺伝子のヌクレオチド配列に基づく876のオリゴヌクレオチドプローブを有していた。それから,全コミュニティゲノム増幅と設計されたマイクロアレイによって検出を結びつける分析法は,川水や廃水処置ヘドロサンプル中の窒素循環微生物をモニターするために適用された。開発された方法は,川水の窒素循環微生物が,地方の廃水処理プラントからの廃水の入力に応じて,多様にならないように見えることを明らかにした。その上,嫌気性アンモニウム酸化と部分的な硝化リアクターと関連した窒素循環コミュニティは,開発された方法によって分析されることができた。しかし,ほとんど等しい廃水処理能力をもつ地方の廃水処置プラントからの2つの活性スラッジサンプルに対し,得られた結果は,大いに互いと異なった。これらの結果は,開発された方法が窒素循環微生物の広範囲の分析に役立つことを示唆した,しかし,大量の非標的化集団をもつ複雑なサンプルへの適用性はさらに検討しなければならない。Copyright 2014 Springer Science+Business Media Dordrecht Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *DNAマイクロアレイ ,  *窒素循環 ,  河川水 ,  *遺伝学実験技術 ,  微生物 ,  環境モニタリング ,  活性汚泥 ,  *全ゲノム増幅
準シソーラス用語： 活性スラッジ

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  水質汚濁一般  (SB02010U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 窒素循環 ,  遺伝子 ,  コミュニティ ,  ゲノム ,  増幅 ,  支援 ,  DNAマイクロアレイ ,  開発