文献

J-GLOBAL ID：201402227335499596   整理番号：11A1043827

中国ナツメ(Zizyphus jujuba Mill.)において選択的に増幅したマイクロサテライト(SAM)解析システムの構築と最適化

Establishment and Optimization of Selectively Amplified Microsatellite (SAM) Analysis System on Chinese Jujube (Zizyphus jujuba Mill.)

著者 (3件)： MA Qing-hua (Res. Inst. of Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Beijing) ,  WANG Gui-xi (Res. Inst. of Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Beijing) ,  LIANG Li-song (Res. Inst. of Forestry, Chinese Acad. of Forestry, Beijing)
資料名： Zhongguo Nongye Kexue  (Zhongguo Nongye Kexue)
巻： 43  号： 2  ページ： 371-379  発行年： 2010年 
JST資料番号： W1459A  ISSN： 0578-1752  CODEN： CKNYAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本研究の目的は,SAM(選択的に増幅したマイクロサテライト)分析システムを構築および最適化し,中国ナツメの集団遺伝学における研究方法を改良し,中国ナツメにおける参照とテンプレートを,SAMを用いたSSRプライマー開発に提供することである。[方法]高品質のゲノムDNAは,改善したCTAB方法によって異なるナツメ栽培品種(Dongzao,DalilongzaoとJinsixiaozao)の葉から分離した。SAMの反応システムは,酵素消化の最適化および連結反応,抑制-増幅,前増幅およびSAM選択的増幅によって構築した。[結果]2段階酵素消化と連結反応は,全システムにおいて鍵となる段階であると承認された。抑制-増幅(全量は20.0μLであった)において,適切なテンプレート量は,消化と連結反応の産物の2.0μLを含むことが試験され,前増幅およびSAM選択的増幅(全量は20.0μLであった)において,適切なテンプレート量は,上記の増幅反応の希釈産物の2.0μLであった。抑制-増幅と前増幅において,0.5UのExTaqを反応混合物で用い,2つの増幅はそれぞれ25サイクル行った。反応後,産物をTEバッファーで1:20に希釈した。SAM選択的増幅において,アニーリング温度は,最初の6サイクルで1サイクルにつき1°C減らしながら,増幅の精度のためにExTaqを1.0U加えて実行した。[結論]16対のMseIアダプター+NNプライマーとSSRプライマー(PCT_6)を,SAM選択的増幅のために設計し,16プライマーの組み合わせの全てで高多型の十分な増幅バンドを認めた。構築したSAM反応システムは,中国ナツメ個体群における,集団構造,遺伝的多様性とSSRプライマー開発の調査に用いることができた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *クロウメモドキ科 ,  *マイクロサテライト ,  栽培品種 ,  生物多様性 ,  酵素的分解 ,  DNAマーカー ,  DNA【核酸】 ,  *遺伝学実験技術 ,  集団遺伝
準シソーラス用語： *ナツメ ,  遺伝的多様性 ,  SSRマーカー ,  ゲノムDNA

分類 (3件)： 遺伝学一般  (EC01010C) ,  作物の品種  (FC02020V) ,  果樹  (FC03042G)

タイトルに関連する用語 (8件)： 中国 ,  ナツメ ,  増幅 ,  マイクロサテライト ,  SAM ,  解析システム ,  構築 ,  最適化