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J-GLOBAL ID：201402231675199977   整理番号：14A1140288

植物関連群集構造の研究における細菌のSSU rRNA遺伝子をPCRにより選択的に増幅するためのlocked核酸(LNA)オリゴヌクレオチド-PCRクランプ法の適用

Application of Locked Nucleic Acid (LNA) Oligonucleotide-PCR Clamping Technique to Selectively PCR Amplify the SSU rRNA Genes of Bacteria in Investigating the Plant-Associated Community Structures

著者 (2件)： IKENAGA Makoto (Fac. of Agriculture, Kagoshima Univ.) ,  SAKAI Masao (Fac. of Agriculture, Kagoshima Univ.)
資料名： Microbes and Environments  (Microbes and Environments)
巻： 29  号： 3  ページ： 286-295 (J-STAGE)  発行年： 2014年 
JST資料番号： L0704A  ISSN： 1342-6311  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： オルガネラSSU rRNA遺伝子は細菌特異的なプライマーセッ...

シソーラス用語： *オリゴヌクレオチド ,...
準シソーラス用語： オルガネラ ,...

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分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (50件)：

• 1. Amann, RI, W Ludwig, and KH Schleifer. 1995. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation. Microbiol Rev. 59:143-169.
• 2. Ashelford, KE, AJ Weightman, and JC Fry. 2002. PROMEROSE: a computer program for generating and estimating the phylogenetic range of 16S rRNA oligonucleotide probes and primers in conjunction with the RDP-II database. Nucleic Acids Res. 30:3481-3489.
• 3. Burbano, CS, B Reinhold-Hurek, and T Hurek. 2010. LNA-substituted degenerate primers improve detection of nitrogenase gene transcription in environmental samples. Environ Microbiol Rep. 2:251-257.
• 4. Chelius, M, and EW Triplett. 2001. The diversity of archaea and bacteria in association with the roots of Zea mays L. Microb Ecol. 41:252-263.
• 5. Dent, KC, JR Stephen, and WE Finch-Savage. 2004. Molecular profiling of microbial communities associated with seeds of Beta vulgaris subsp. Vulgaris (sugar beet). J. Microbiol Methods. 56:17- 26.

タイトルに関連する用語 (11件)： 植物 ,  群集構造 ,  研究 ,  細菌 ,  rRNA遺伝子 ,  PCR ,  増幅 ,  核酸 ,  LNA ,  オリゴヌクレオチド ,  クランプ