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J-GLOBAL ID：201402232318964327   整理番号：13A1951914

立体配座空間において距離を測定する測定基準

Metrics for measuring distances in configuration spaces

著者 (6件)： SADEGHI Ali (Dep. of Physics, Universitaet Basel, Klingelbergstr. 82, 4056 Basel, CHE) ,  GHASEMI S. Alireza (Dep. of Physics, Universitaet Basel, Klingelbergstr. 82, 4056 Basel, CHE) ,  SCHAEFER Bastian (Dep. of Physics, Universitaet Basel, Klingelbergstr. 82, 4056 Basel, CHE) ,  MOHR Stephan (Dep. of Physics, Universitaet Basel, Klingelbergstr. 82, 4056 Basel, CHE) ,  LILL Markus A. (Dep. of Medicinal Chemistry and Molecular Pharmacology, Coll. of Pharmacy, Purdue Univ., 575 Stadium Mall Drive ...) ,  GOEDECKER Stefan (Dep. of Physics, Universitaet Basel, Klingelbergstr. 82, 4056 Basel, CHE)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 139  号： 18  ページ： 184118-184118-11  発行年： 2013年11月14日 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子構造を特性化するため,実験的に構造を同定するために用いられる量である配座指紋ベクトルを導入した。配座指紋ベクトル間のユークリッド距離は測定基準の性質を満足し,高次元立体配座空間中の配座間の非類似性の測定に用いることができる。とくに,二つのノイズ汚染した配座が同一か否かを決定する必要がある場合に,これらの測定基準は完全で,二乗平均距離(RMSD)の計算コストの低い置換物となることを示した。立体配座間のRMSDの大域的極小値を求めるモンテカルロ法を導入した。この極小値は,全ての並進,回転及び原子指標の順列について大域的極小化により得られたものである。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： 指標 ,  *立体配座 ,  *距離測定 ,  分子構造 ,  核間距離 ,  雑音 ,  雑音安定度 ,  実効値 ,  距離 ,  シミュレーション ,  極小値 ,  *ベクトル
準シソーラス用語： ノイズ ,  ノイズ耐性 ,  メトリックス ,  モンテカルロシミュレーション ,  原子間距離 ,  *特徴ベクトル ,  *分子立体配座 ,  二乗平均平方根

分類 (2件)： 分子の立体配置・配座  (BH05022J) ,  物理化学一般その他  (CB01030T)

タイトルに関連する用語 (1件)： 立体配座